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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】CVFF力场能导入NAMD中么?
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kingtin

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】CVFF力场能导入NAMD中么? 已有2人参与

请问CVFF力场能导入NAMD中么? 如果能的话,如何才能做到?
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1楼 2010-10-28 17:18:13
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kingtin

银虫 (小有名气)

解释一下

★
zh1987hs(金币+1):鼓励交流 2010-10-30 21:15:51
解释一下,我就是想,在NAMD的模拟中使用cvff力场,但是好像NAMD不支持.所以,我想,能不能人工地做一个力场文件,然后在NAMD里面用.不晓得这个方案是否行得通?
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2楼2010-10-30 17:11:24
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043114076

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+4):谢谢 2010-10-31 08:26:09
没有用过namd，但理论上是可以的。需要注意几个地方：
1.cvff 力场包含交叉项，如果namd不支持的话，就麻烦了
2.力场的单位
3.vdw 势，cvff势使用12-6形式，不同于常用的L-J势，参数的组合规则也不同，用时一定要细心。
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3楼2010-10-31 07:46:34
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