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飘在海上的雪

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】Takara反转录试剂盒中oligo dT 和 random 6 mers的差别 已有10人参与

做RNA反转录是选用了Takara的试剂盒,里面有两个引物,oligo 和random,这两个有什么差异。我分别做了后续试验,P出产物的条带oligo的亮度比不上random,各位虫虫知道怎么回事吗?
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麦兜响当当

金虫 (初入文坛)

觉主

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
rainwander(金币+2): 鼓励积极参与交流~~~ 2011-03-19 09:45:32
Random 6 mers为随机的6核苷酸引物,引物序列为5'-(P)NNNNNN-3',其5'端和3'端均含有-OH,因此可往两端延伸,特点是产物量大,特异性差,适用于长的或具有Hairpin构造的RNA。包括rRNA、mRNA、tRNA等在内的所有RNA的反转录反应都可使用本引物。
    Oligo dT Primer适用于具有Poly(A)Tail的RNA,因而特异性好,但因其只结合Poly A尾巴,对于较长的mRNA,经常不能延伸到5'端。(原核生物的RNA、真核生物的rRNA、tRNA以及某些种类真核生物的mRNA等不具有Poly(A)Tail)。
    两种引物可据实际情况使用一种,也可同时使用。还有一种情况,当只扩增一种目的基因时,也可以使用Specific Primer(PCR时的下游引物)作为反转录引物。
4楼2011-03-18 22:14:54
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普通回帖

ben1147

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
dhd997(金币+1):鼓励交流。 2010-10-28 08:39:56
oligo(dT)只能结合到有poly(A)尾的RNA上
random可以随机结合到任何序列
2楼2010-10-27 21:30:54
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飘在海上的雪

木虫 (正式写手)

reasonspare:不一定,oligo dT,更适合真核生物,随机引物,适用于原核生物,后者没有polyA 2010-10-28 08:42:26
引用回帖:
Originally posted by ben1147 at 2010-10-27 21:30:54:
oligo(dT)只能结合到有poly(A)尾的RNA上
random可以随机结合到任何序列

这样我的试验是不是选用random比较好?
不在沉默中爆发,就在沉默着死亡!
3楼2010-10-27 23:21:25
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taigongzaici

新虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 飘在海上的雪 at 2010-10-27 23:21:25:
这样我的试验是不是选用random比较好?

很棒的解释,呵呵,顶,必须加精
5楼2011-03-19 20:20:50
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taigongzaici

新虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 麦兜响当当 at 2011-03-18 22:14:54:
Random 6 mers为随机的6核苷酸引物,引物序列为5'-(P)NNNNNN-3',其5'端和3'端均含有-OH,因此可往两端延伸,特点是产物量大,特异性差,适用于长的或具有Hairpin构造的RNA。包括rRNA、mRNA、tRNA等在内的所有RNA ...

很棒的帖子,加精
6楼2011-03-19 20:21:21
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ailunwen

铜虫 (初入文坛)

我也遇到了同样的疑惑


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
谢谢楼主发贴解除了我们的疑惑!
爱知识,长智慧!
7楼2011-03-20 10:10:32
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过氧化氢

铁虫 (初入文坛)

★ ★
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dhd997(金币+1): 鼓励交流 2011-03-24 13:37:10
oligo dT适合有Poly(A)尾巴的RNA上
8楼2011-03-24 10:52:29
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荣rong006

新虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
谢谢解疑,我也有这样的疑问
9楼2011-04-21 08:59:56
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xjzw

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
很好,刚好也解决了我的疑问,顶
10楼2012-11-05 18:31:26
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