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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】surflex-dock问题
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lvjuanhuhu

铜虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】surflex-dock问题 已有2人参与

在对接前我想设置一下配体的其中一个基团与受体大分子的某一个残基的距离为固定值，请问应该怎么在surflex-dock里面设置？
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1楼 2010-10-26 11:36:40
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skee2008

金虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+1):谢谢 2010-10-29 14:24:18
这个貌似不行哎，那个-fmatch命令好像就只能限定某个亚基团的位置罢了，我原来也想用surflex做类似的对接，发现好像行不通，工程师说的很模糊，意思就是不行
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有舍有得
2楼2010-10-29 14:12:03
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lvjuanhuhu

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by skee2008 at 2010-10-29 14:12:03:
这个貌似不行哎，那个-fmatch命令好像就只能限定某个亚基团的位置罢了，我原来也想用surflex做类似的对接，发现好像行不通，工程师说的很模糊，意思就是不行

多谢指教，那阁下是用什么软件解决的这个问题呢
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3楼2010-11-02 23:14:57
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chemozhang

木虫 (正式写手)
帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《分子对接问题锦集》
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故地如重游月圆更寂寞
4楼2011-09-05 20:05:13
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