应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 【求助】MS中分子动力学计算
51/1返回列表
查看: 3839  |  回复: 19
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

咖啡喝不醉

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】MS中分子动力学计算已有9人参与

MS 中分子动力学计算方面在进行NPT动力学模拟的时候，运行了很久之后结果以失败而告终。请问问题可能出现在哪里呢？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼2010-10-21 08:56:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gengcy

木虫 (小有名气)

可能的原因

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-11-03 09:29:32
模拟过程中可能出现了分子重叠的现象，简单的说就是模拟过程中分子距离可能太近或者几乎在同一位置，导致运行出错。建议重新考察一下力场是否合适，在模拟前先将盒子进行优化，使盒子能量降低，然后再进行动力学模拟。
赞一下(2人) 回复此楼
5楼2010-11-03 09:19:22
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 20 个回答

lianglinlin

金虫 (初入文坛)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+1):谢谢 2010-10-21 16:02:16
你可以去out结果中查看，里面会写出错的原因的
赞一下(3人) 回复此楼
2楼2010-10-21 09:50:28
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

amynihao

金虫 (正式写手)

寂寞大虫
★
zh1987hs(金币+1):谢谢 2010-10-21 16:02:23
或者换个力场再试试
赞一下(2人) 回复此楼
不是要做一个单纯优秀的人，而是要做一个不可替代的人。
3楼2010-10-21 10:22:26
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xjw040

金虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+1):谢谢 2010-10-26 07:56:22
可能是你的能量tolerance的值有关。最好设置得大些!
赞一下(3人) 回复此楼
4楼2010-10-26 07:33:36
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 20 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复(可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭