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sjwangustc

木虫 (正式写手)

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[交流] 【求助】几个A类错误如何修正？已有1人参与

请教如下几个A类错误如何修正：
（1） Check High Ueq as Compared to Neighbors for N3
（2）Check Low Ueq as Compared to Neighbors for C39
（3）Coordinates do not Form a Properly Connected Set
（4）Too many H on C in C=N Moiety in Solvent/Ion ... C52
（5）ADP of Atom N6 is N.P.D. or (nearly) 2D ... ?
（6）Large Non-Solvent C Ueq(max)/Ueq(min) ... 5.20 Ratio
（7）Atom C10 has ADP max/min Ratio ..... 15.90 prola

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1楼 2010-10-19 21:25:06

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lanmao20

金虫 (正式写手)

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sjwangustc(金币+10): 2010-10-21 10:46:13

（1） Check High Ueq as Compared to Neighbors for N3 N3热温度因子过高，需要修无序，也许。。。
（2）Check Low Ueq as Compared to Neighbors for C39 还是有无序，所以与其他碳原子比较，该碳原子温度因子较低，需要注意的是，一定要对温度因子异常的原子一再确定是否是碳原子或氮原子。。。
（3）Coordinates do not Form a Properly Connected Set  配位方式有问题，可能需要爱移动残片，用envi和sgen命令
（4）Too many H on C in C=N Moiety in Solvent/Ion ... C52 貌似这里的h加的有问题。。。
（5）ADP of Atom N6 is N.P.D. or (nearly) 2D ... ?  n6原子有问题，如果确定是n原子，可以试试isor命令
（6）Large Non-Solvent C Ueq(max)/Ueq(min) ... 5.20 Ratio  还是c原子存在无序造成的的。。。。
（7）Atom C10 has ADP max/min Ratio ..... 15.90 prola  同样的c无序

以上问题我觉得可以再好好看看结构和数据，如果无序实在很严重但原子指认没有问题，那么数据差不多也是可以的，只要说明就好了，但是最好好好处理小，祝你好运！