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sjwangustc

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】几个A类错误如何修正? 已有1人参与

请教如下几个A类错误如何修正:
(1) Check High Ueq as Compared to Neighbors for N3
(2)Check Low Ueq as Compared to Neighbors for C39
(3)Coordinates do not Form a Properly Connected Set
(4)Too many H on C in C=N Moiety in Solvent/Ion ... C52
(5)ADP of Atom N6 is N.P.D. or (nearly) 2D ... ?
(6)Large Non-Solvent C Ueq(max)/Ueq(min) ... 5.20 Ratio
(7)Atom C10 has ADP max/min Ratio ..... 15.90 prola
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nokian1985

木虫 (正式写手)


nash603(金币+1):谢谢回贴交流! 2010-10-20 08:36:59
sjwangustc(金币+1): 2010-10-20 09:13:38
问题很多啊,,每个原子再好好修一修
2楼2010-10-19 21:57:19
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hjh509

铁杆木虫 (职业作家)

sjwangustc(金币+1): 2010-10-20 09:13:41
很多原子还没有定好,建议再次精修
111
3楼2010-10-20 08:49:27
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xglegl

木虫 (正式写手)

sjwangustc(金币+1): 2010-10-20 09:13:46
很麻烦 不是这样指导就能修好的
4楼2010-10-20 09:10:29
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sjwangustc

木虫 (正式写手)

有没有可能是晶体的数据不好导致的?
5楼2010-10-20 09:14:25
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454106649

木虫 (著名写手)

~~

sjwangustc(金币+4): 2010-10-20 11:24:33
加simu指令,氢加的有问题~这两个先解决check一下,看看有什么问题,接着修!
454106649@qq.com
6楼2010-10-20 09:22:26
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liyaoman4

木虫 (职业作家)

傻傻又痴痴的文四

sjwangustc(金币+2): 2010-10-21 10:46:20
一堆原子分裂,配位不对,光是精修跟本就没多大作用,还是请高人帮帮你吧!
五百次的回眸换来今生一次擦肩而过,可否用一次檫肩而过换你来生五百次回眸?
7楼2010-10-21 09:55:16
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lanmao20

金虫 (正式写手)

sjwangustc(金币+10): 2010-10-21 10:46:13
(1) Check High Ueq as Compared to Neighbors for N3   N3热温度因子过高,需要修无序,也许。。。
(2)Check Low Ueq as Compared to Neighbors for C39   还是有无序,所以与其他碳原子比较,该碳原子温度因子较低,需要注意的是,一定要对温度因子异常的原子一再确定是否是碳原子或氮原子。。。
(3)Coordinates do not Form a Properly Connected Set  配位方式有问题,可能需要爱移动残片,用envi和sgen命令
(4)Too many H on C in C=N Moiety in Solvent/Ion ... C52   貌似这里的h加的有问题。。。
(5)ADP of Atom N6 is N.P.D. or (nearly) 2D ... ?  n6原子有问题,如果确定是n原子,可以试试isor命令
(6)Large Non-Solvent C Ueq(max)/Ueq(min) ... 5.20 Ratio  还是c原子存在无序造成的的。。。。
(7)Atom C10 has ADP max/min Ratio ..... 15.90 prola  同样的c无序

以上问题我觉得可以再好好看看结构和数据,如果无序实在很严重但原子指认没有问题,那么数据差不多也是可以的,只要说明就好了,但是最好好好处理小,祝你好运!
8楼2010-10-21 10:11:59
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yuezhifang

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
ADP of Atom N6 is N.P.D. or (nearly) 2D ... ?  用eadp命令
Large Non-Solvent C Ueq(max)/Ueq(min) ... 5.20 Ratio 用simu 0.01 0.02 3.8 $c
Atom C10 has ADP max/min Ratio ..... 15.90 prola  试一下simu 0.01 0.07 7.0 $c
9楼2013-05-02 13:55:42
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