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【求助/交流】关于16srRNA菌种鉴定问题已有3人参与
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第一次发帖，好紧张 自己筛了一株细菌，对其进行了诱变，拿到北京一个民营的菌种鉴定中心进行16srRNA的鉴定，结果出来后，去NCBI进行比对，发现诱变前后两株菌不是一个种，本来是想比较诱变前后基因序列的变化，现在显示竟然不是一株菌，心里那个凉啊。 我对分子生物学不是很懂，在这里请教一下高手：对细菌进行诱变后，会使细菌的种属发生改变吗？我还怀疑是不是鉴定中心的人给搞错了，他们说比对的时候减去前面的50个碱基和后面150个碱基，我不明白是什么意思？是不是前面50个碱基里有引物片段，不准确？ 请高手指点。多谢了 |
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7楼2010-10-18 21:10:08
天龙n部
金虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
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- 性别: GG
- 专业: 微生物生理与生物化学
16s还是很保守序列啊。2楼2010-10-16 14:19:59
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coolairen(金币+1):谢谢参与
dhd997(金币+1):谢谢交流。 2010-10-16 14:50:34
coolairen(金币+1):谢谢参与
dhd997(金币+1):谢谢交流。 2010-10-16 14:50:34
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实在是不明白你做过诱变后，去做16sRNA鉴定是做什么用的，16sRNA是用来鉴定菌种的，你要是不知道你的菌是什么种属，才去做菌种鉴定，你这都知道是什么菌了，去做什么啊，先不管你做的成功不成功，你这方法有点问题吧。 其次，你诱变后是用来做什么的，你先看诱变后对你要的东西有没有变，要是变了再找寻相关的基因序列和蛋白表达等的变化。 你原来的菌种已经已知种属了吗？要是已知的或是鉴定过，那么有可能是聚合酶的问题或提基因组时养菌染菌了。要是没有明确鉴定过，请确认一下通用引物是不是有什么问题。 |
3楼2010-10-16 14:42:55
silicare
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4楼2010-10-16 15:06:49