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QQ84508540

捐助贵宾 (小有名气)

强迫症患者

[交流] 【求助/交流】16sRNA怎么提取?以及相关名词不太懂。求助! 已有8人参与

各位虫友,我也是初涉这个领域,对16sRNA提取有很多不理解,虽然知道诸如PCR等知识的原理,但是在具体提取过程中,还是不太清楚其步骤,更没做过了,像使用的TE、PCR反应体系、TE一RNaseA、EBbuffe……等不太懂,还有构建引物是根据什么去做,或者选择,试剂盒是怎么回事,要想拿到公司去测序,我需要做到哪步后再送过去测序?

貌似问题有点弱弱的,但是真的不太懂,百度搜出来一大片,不如请虫友通俗的讲讲,谢谢帮忙。

要是有此类实验的具体步骤的课件或者实验设计,希望能给予分享,谢谢啦。

我需要做的菌种是一种芽孢杆菌,具体是什么类型还不清楚。

邮箱:84508540@163.com


[ Last edited by QQ84508540 on 2010-8-31 at 22:18 ]
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won7

金虫 (小有名气)

★ ★
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silicare(金币+1):非常正确 2010-09-01 08:16:04
感觉这位虫友对分子生物的知识和技术知之甚少,建议先看一点有关分子生物学的书再做,从基础开始。如果身边有人做分子生物学实验,最好向他们请教,这样事半功倍。在这里你一无了解,让人怎么教啊!
2楼2010-08-31 22:31:45
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QQ84508540

捐助贵宾 (小有名气)

强迫症患者

引用回帖:
Originally posted by won7 at 2010-08-31 22:31:45:
感觉这位虫友对分子生物的知识和技术知之甚少,建议先看一点有关分子生物学的书再做,从基础开始。如果身边有人做分子生物学实验,最好向他们请教,这样事半功倍。在这里你一无了解,让人怎么教啊!

这个,呵呵,的确说的对哦~分子生物学学过点,的确知之甚少,做的更少了,现在涉及到这方面的了,着急呀~~哎……有没有类似实验的实验步骤什么的,自学应该还是很有信心的,谢谢你的帮助哦~
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3楼2010-09-01 00:31:17
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虫子火箭兵

金虫 (正式写手)

★ ★
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silicare(金币+1):非常好的idea~ 2010-09-01 08:16:24
去知网CNKI上找一些研博士的相关毕业论文,那些文章一般步骤讲的比较清楚
4楼2010-09-01 07:41:17
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QQ84508540

捐助贵宾 (小有名气)

强迫症患者

引用回帖:
Originally posted by 虫子火箭兵 at 2010-09-01 07:41:17:
去知网CNKI上找一些研博士的相关毕业论文,那些文章一般步骤讲的比较清楚

好的,谢谢提醒哦~嘿嘿

正在努力看
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5楼2010-09-01 10:34:12
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linxi8579

铜虫 (正式写手)


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不明白提RNA跟PCR有什么关系啊,楼主要做什么啊?
6楼2010-09-01 11:39:16
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QQ84508540

捐助贵宾 (小有名气)

强迫症患者

引用回帖:
Originally posted by linxi8579 at 2010-09-01 11:39:16:
不明白提RNA跟PCR有什么关系啊,楼主要做什么啊?

提取→扩增→测序→鉴定。
芽孢杆菌这样做能鉴定到种吗?
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7楼2010-09-01 11:42:32
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linxi8579

铜虫 (正式写手)


silicare(金币+1):谢谢参与 2010-09-01 12:15:18
引用回帖:
Originally posted by QQ84508540 at 2010-09-01 11:42:32:



提取、扩增、测序、鉴定。

你是要测序RNA对应的表达的DNA对吧,步骤应该是提取、反转、PCR、回收后测序鉴定。如果说测序RNA一般没有你这样的,一般是测序小RNA,这个东西提出来给公司测,大体过程就是加接头、反转、PCR、测序。
8楼2010-09-01 11:46:03
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QQ84508540

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强迫症患者

引用回帖:
Originally posted by linxi8579 at 2010-09-01 11:46:03:

你是要测序RNA对应的表达的DNA对吧,步骤应该是提取、反转、PCR、回收后测序鉴定。如果说测序RNA一般没有你这样的,一般是测序小RNA,这个东西提出来给公司测,大体过程就是加接头、反转、PCR、测序。

嗯,是的测16sRNA即可,就是前面提取的实验步骤不太会,不知道该怎么做,从网上也没找到细菌的,只有酵母的,而且需要液氮,我这没有这个东东哦~只要做到扩增完然后拿去测序就行。
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9楼2010-09-01 11:56:47
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zhaoyu2881

木虫 (正式写手)


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引用回帖:
Originally posted by QQ84508540 at 2010-09-01 11:42:32:



提取→扩增→测序→鉴定。
芽孢杆菌这样做能鉴定到种吗?

测序之后在NCBI里进行序列比对,选择合适的参比菌株,如果需要可以构建系统发育树,基本上都可以鉴定到种。祝楼主好运!
Thatislife,onlylifehurts.
10楼2010-09-01 22:42:15
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