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xmdxn

铁虫 (初入文坛)

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[交流] 【求助】Gaussian09作业中断，可否接着断点继续计算？已有6人参与

如题。
正在用td-b3lyp优化perylene的激发态，分子是C20H12，基组是6-311+g**，跑频率分析跑了四五天还没有跑出来，恰好又遇到服务器死机。。。
哪位知道Gaussian09的作业中间断掉可不可以接着断点计算啊？小弟裸膝跪拜，不胜感激~

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1楼 2010-10-15 12:50:51

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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)

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zhou2009(金币+3): 2010-10-16 16:07:10

激发态优化频率用的是数值梯度，计算过程总共需要计算6N＋1次SCF和TD。
N为原子个数，你看看你的输出文件里有多少次SCF Done了？用6N＋1减去这个数字就是还需要跑的次数，大致应该能估算出时间的。

提供一个脚本，可以用来检查激发态频率已经跑了多少步，还需要跑多少步。

CODE:

#!/bin/sh

if [ $# -ne 1 ]

then

        echo "Usage: $0 Gaussian output file"

        exit 1

fi

if [ ! -e $1 ]

then

        echo "$1 not existed!"

        exit 1

fi

scf_iters=`grep "SCF Done" $1 | wc -l`

natoms=`grep "NAtoms" $1 | awk '{print $2}'| head -1`

left_iters=$(($natoms*6+1-$scf_iters))

echo ""

echo "The SCF has runned for $scf_iters cycles"

echo -e "Still need \033[45m\033[5m $left_iters \033[0m cycles"

echo ""

顺便提一下，G09的频率计算绝对可以接着算，前提是保存了rwf文件，具体如何做，请参考说明书上restart关键词的说明。

引用回帖:

Originally posted by xmdxn at 2010-10-16 14:27:36:

我现在又换了6-31+g*和6-31g*继续优化和频率分析，激发态的优化很快，一般两个小时就可以做出来，但是频率分析还是要跑很久，目前跑了两千五百分钟还是没有跑出来，不停地出现
...

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7楼2010-10-16 15:11:09

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manson1998

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引用回帖:

Originally posted by xmdxn at 2010-10-15 12:50:51:
如题。
正在用td-b3lyp优化perylene的激发态，分子是C20H12，基组是6-311+g**，跑频率分析跑了四五天还没有跑出来，恰好又遇到服务器死机。。。
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