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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】Gaussian09作业中断，可否接着断点继续计算？
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xmdxn

铁虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】Gaussian09作业中断，可否接着断点继续计算？ 已有6人参与

如题。
正在用td-b3lyp优化perylene的激发态，分子是C20H12，基组是6-311+g**，跑频率分析跑了四五天还没有跑出来，恰好又遇到服务器死机。。。
哪位知道Gaussian09的作业中间断掉可不可以接着断点计算啊？小弟裸膝跪拜，不胜感激~
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1楼 2010-10-15 12:50:51
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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
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zhou2009(金币+3): 2010-10-16 16:07:10
激发态优化频率用的是数值梯度，计算过程总共需要计算6N＋1次SCF和TD。
N为原子个数，你看看你的输出文件里有多少次SCF Done了？用6N＋1减去这个数字就是还需要跑的次数，大致应该能估算出时间的。

提供一个脚本，可以用来检查激发态频率已经跑了多少步，还需要跑多少步。
CODE:
#!/bin/sh

if [ $# -ne 1 ]
then
        echo "Usage: $0 Gaussian output file"
        exit 1
fi

if [ ! -e $1 ]
then
        echo "$1 not existed!"
        exit 1
fi

scf_iters=`grep "SCF Done" $1 | wc -l`
natoms=`grep "NAtoms" $1 | awk '{print $2}'| head -1`
left_iters=$(($natoms*6+1-$scf_iters))
echo ""
echo "The SCF has runned for $scf_iters cycles"
echo -e "Still need \033[45m\033[5m $left_iters \033[0m cycles"
echo ""

顺便提一下，G09的频率计算绝对可以接着算，前提是保存了rwf文件，具体如何做，请参考说明书上restart关键词的说明。
引用回帖:
Originally posted by xmdxn at 2010-10-16 14:27:36:


我现在又换了6-31+g*和6-31g*继续优化和频率分析，激发态的优化很快，一般两个小时就可以做出来，但是频率分析还是要跑很久，目前跑了两千五百分钟还是没有跑出来，不停地出现
                             ...

赞一下(2人) 回复此楼
7楼2010-10-16 15:11:09
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manson1998

金虫 (著名写手)

OLED达人
引用回帖:
Originally posted by xmdxn at 2010-10-15 12:50:51:
如题。
正在用td-b3lyp优化perylene的激发态，分子是C20H12，基组是6-311+g**，跑频率分析跑了四五天还没有跑出来，恰好又遇到服务器死机。。。
哪位知道Gaussian09的作业中间断掉可不可以接着断点计算啊？小弟 ...

perhaps not
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惺惺相惜情不自禁
2楼2010-10-15 13:22:06
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xmdxn

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by manson1998 at 2010-10-15 13:22:06:


perhaps not

what a pity...
不知道大家有没有用td优化激发态几何构型的经验，做频率分析的速度是不是对基组大小很敏感？我正在考虑换小基组做下去了。。。
赞一下 回复此楼
3楼2010-10-15 16:08:05
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gougaozhan

至尊木虫 (职业作家)

busy
★ ★
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zhou2009(金币+1): 2010-10-16 15:59:58
基组6-311+g**太大了，难怪跑不过去
赞一下(2人) 回复此楼
^_^不要生气||要争气，不要看破||要突破，不要嫉妒||要欣赏，不要托延||要积极，不要心动||要行动^_^
4楼2010-10-15 17:37:57
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