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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】还是收敛测试和几何优化的问题，又来麻烦大家了...
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xiaobai216

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】还是收敛测试和几何优化的问题，又来麻烦大家了...

背景： 64个硅原子的晶胞（金刚石结构），在中心掺杂一个Sn原子，在其最近邻位设置一个空位，进行收敛测试。
1.在k点保证足够大的情况下，可以选择280eV之上的Ecut吗？上次做的图在这个帖子里：     http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2460862

2.选择了Ecut后经结构优化后的总能绝对值有绝对意义吗？很多文献中取相对值，取   掺杂原子无限远处的一个空位计算总能，依此为参照得出相对值，那么这个无限远处的原子在64个原子的晶胞中取哪里的原子可以近似替代呢？

3.优化时边界原子固定，去掉一个边界原子构建空位时计算的总能与去掉体内未固定原子形成的空位计算得到的总能是否有可比性？
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第一性原理新手...非常非常新
1楼 2010-10-09 23:06:31
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主
★ ★ ★
zxzj05(金币+3):奖励交流！ 2010-10-10 13:29:01
xiaobai216(金币+10):谢谢解答^_^ 2010-10-10 13:58:39
1.可以。Ecut的选择再参考一下文献。稍大是可以的。过大就没有必要，显得很不专业。只要精度够就可以。另外，Ecut的物理意义和对计算结果的影响建议你再了解一下。
2.绝对能量没有意义。“以掺杂原子无限远处的空位计算总能”，这个是什么意思呢？你要计算掺杂结构空位形成能？
3.固定边界上的原子空位，与体内自由原子空位所处环境不同，能量会有一定差别。这个比较好像没什么必要。

供参考!
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2楼2010-10-10 09:34:35
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xiaobai216

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by cenwanglai at 2010-10-10 09:34:35:
1.可以。Ecut的选择再参考一下文献。稍大是可以的。过大就没有必要，显得很不专业。只要精度够就可以。另外，Ecut的物理意义和对计算结果的影响建议你再了解一下。
2.绝对能量没有意义。“以掺杂原子无限远处的空 ...

我是想计算掺杂原子与空位的相互作用，也就是中心掺杂一个Sn原子，在其第一第二...近邻位构建空位，计算体系总能。

关于第二个问题，因为绝对值没有意义，所以我想以空位据Sn原子在较远处时的体系能量为基础，算其他结构相对于这一情况下的相对能量，在64原子的晶胞中该怎么实现这个较远处的空位的体系能量计算呢？
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第一性原理新手...非常非常新
3楼2010-10-10 14:03:14
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vaspstudy

银虫 (小有名气)
xiaobai216(金币+10):非常感谢^_^ 2010-10-11 20:56:18
引用回帖:
Originally posted by xiaobai216 at 2010-10-09 23:06:31:
背景： 64个硅原子的晶胞（金刚石结构），在中心掺杂一个Sn原子，在其最近邻位设置一个空位，进行收敛测试。
1.在k点保证足够大的情况下，可以选择280eV之上的Ecut吗？上次做的图在这个帖子里：     [url]http:/ ...

1. 具体没试过，但如果不放心可以在优化后的结构进行一个静态计算，增加Ecut（如到350eV），相信不会花费很多时间，然后比较两个Ecut的能量收敛性，这一收敛性在写论文时可以作为误差估计进行说明，所以这一试验还是值得的；
2. 第一性的总能绝对值有意义的应该不多，感觉楼主是不是要通过能量来说明稳定性之类，如果这样最好计算形成能，这是稳定性评判的重要依据；
3. 如果去掉边界原子形成空位，优化时就不应该将边界原子固定；如果在放开边界原子的前提下，只要supercell足够大，边界空位与内部空位得到的总能应该是一致的，但实际超胞总是有限的，所以实际计算的能量可能具有一定差异。如此类问题，总能应该具有可比性。
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4楼2010-10-11 18:06:58
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