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romance

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】分子模拟,这个想法要是能实现就好了

如题,我是化学方向的,不懂分子模拟,可是有个想法:要是有什么软件可以实现1.单个化合物的3D直观结构(键角,键长都可反映出来);2.提供几个反应物,软件能给出反应的难易(时间长短,),反应的进攻方向(最容易反应的部位),以及产物的3D结构 3.提供配体和金属,软件给出配位情况和可能的晶体结构?
    呵呵,要求是不是太理想了?不知道这个想法能不能实现?如果可以的话需要学习哪些方面的知识?先谢谢大家了!
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romance

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by yalefield at 2010-10-09 10:55:30:
1、Chem3D
2、Chem3D+MOPAC
3、Chem3D

呵呵,个人觉得chemoffice 的3D功能不敢恭维,距离真实构型还是有相当差距的!
Nothing doesn't matter!
3楼2010-10-09 11:05:29
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

★ ★
romance(金币+1):谢谢参与,chem3D好像不太可靠啊! 2010-10-09 11:07:09
zh1987hs(金币+2):谢谢老汉 2010-10-09 11:11:31
romance(金币+2):非常感谢您的回复,再给2个金币表示感谢! 2010-11-01 10:13:47
1、Chem3D
2、Chem3D+MOPAC
3、Chem3D
2楼2010-10-09 10:55:30
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

★ ★ ★
lei0736(金币+3):谢谢 2010-10-09 12:18:06
romance(金币+3):非常感谢!我也听说量化计算比较难,呵呵! 2010-10-10 10:44:29
romance(金币+3):多谢您的帮助,借助3个金币再次表达我的谢意!! 2010-11-01 10:14:45
估计老汉是考虑到易上手的原因,因为除了最后一个不知道可不可以外,其他的都可以,化合物的3D结构你可以先上CCDC和ZINC数据库找找看有没有已经解析的,反应的难易程度,易进攻的位置可以通过量化软件进行计算,比如Gaussian,Gamess等等。但是你要学习,可能需要花不少时间,请斟酌
4楼2010-10-09 11:14:30
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

★ ★
zh1987hs(金币+2):谢谢老汉 2010-10-09 14:45:50
romance(金币+3):牛人啊!谢了! 2010-10-10 10:46:52
引用回帖:
Originally posted by romance at 2010-10-09 11:05:29:
呵呵,个人觉得chemoffice 的3D功能不敢恭维,距离真实构型还是有相当差距的!

嘻嘻,老汉知道,Chem3D其实就是个架子而已。

真要算什么,还要调用GAMESS, MOPAC, Gaussian和Jaguar。

5楼2010-10-09 14:25:19
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