24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1763  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

我芹菜

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】sybyl对接中水分子处理 已有3人参与

本人是菜鸟一只,刚刚接触分子模拟,使用的是sybyl软件,现在想验证一下,所看文献中的对接结果,即:某蛋白质分子和它的激动剂的作用,但是文献对接的结果中,水分子也和蛋白质或是激动剂形成了氢键作用。本人对于有水分子参与的对接过程不了解,想请问各位进行指导。谢谢。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子对接问题锦集 药物化学

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

我在过马路,你人在哪里。。。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chemozhang

木虫 (正式写手)

帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《分子对接问题锦集
故地如重游月圆更寂寞
5楼2011-09-05 20:12:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

qustwq

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+1):谢谢 2010-09-26 10:05:14
sybyl对接前处理受体与配体的时候都是把水删除的。如果非要考察水分子与蛋白的作用我认为可以在对接完成以后加上水分子做一个动力学。一家之言!请熟悉则方面的专家多多指教!
2楼2010-09-26 09:36:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mike0601

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+1):谢谢 2010-09-26 15:45:50
在去掉小分子那一步时可以不去掉水分子,估计这样可以吧(个人想法,还待检验)
3楼2010-09-26 10:38:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

我芹菜

铜虫 (小有名气)

二楼说的考虑过,但是还没有实施。三楼说的实施过,失败告终。。。
谢谢二位热心
我在过马路,你人在哪里。。。
4楼2010-09-26 15:01:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 290求调剂 +23 luoziheng 2026-04-10 25/1250 2026-04-16 17:25 by 冰雪遇见猪
[考研] 297,工科调剂?河南农业大学本科 +14 河南农业大学-能 2026-04-14 14/700 2026-04-16 14:41 by dingyanbo1
[考研] 一志愿中科大材料与化工,353分还有调剂学校吗 +7 否极泰来2026 2026-04-15 9/450 2026-04-16 13:40 by liumingli7817
[考研] 材料相关专业344求调剂双非工科学校或课题组 +22 hualkop 2026-04-12 24/1200 2026-04-16 10:54 by Espannnnnol
[考研] 药学专硕调剂 +9 ? 一路生?花? 2026-04-10 11/550 2026-04-16 10:49 by noqvsozv
[考研] 求调剂推荐 +8 小聂爱学习 2026-04-14 8/400 2026-04-16 07:22 by 学员JpLReM
[考研] 289 分105500药学专硕求调剂(找B区学校) +4 白云123456789 2026-04-13 4/200 2026-04-16 00:18 by 粉沁若尘
[考研] 药学305求调剂 +10 玛卡巴卡boom 2026-04-10 10/500 2026-04-14 15:55 by zs92450
[考研] 求调剂 +12 何气正 2026-04-13 13/650 2026-04-14 14:47 by zs92450
[考研] 农学0904 312求调剂 +4 Say Never 2026-04-11 4/200 2026-04-14 09:10 by zs92450
[考研] 300分求调剂 (085501机械专硕,本科扬大) +9 xu@841019 2026-04-11 10/500 2026-04-14 08:48 by 木木mumu~
[考研] 本科西工大 324求调剂 +5 wysyjs25 2026-04-10 5/250 2026-04-13 23:08 by pies112
[考研] 297工科,求调剂? +13 河南农业大学-能 2026-04-12 13/650 2026-04-13 14:12 by dingyanbo1
[考研] 339求调剂 +4 hanwudada 2026-04-12 4/200 2026-04-13 12:03 by 蓝云思雨
[考研] 一志愿西北工业大学289 085602 +33 yang婷 2026-04-10 34/1700 2026-04-12 08:11 by Art1977
[考研] 270求调剂 +14 杨乐369 2026-04-11 14/700 2026-04-11 20:16 by 蓝云思雨
[考研] 22408 352分求调剂0854类 +4 努力的夏末 2026-04-09 4/200 2026-04-11 09:57 by zhq0425
[考研] 0858求调剂 5+5 Gky09300550, 2026-04-10 8/400 2026-04-10 19:13 by chemisry
[考研] 一志愿京区985,085401,与本科专业一致,电子信息工程, +4 阳光开朗的男孩 2026-04-10 4/200 2026-04-10 18:27 by shenrf
[考研] 301求调剂 +5 149. 2026-04-10 5/250 2026-04-10 15:45 by 柴小白
信息提示
请填处理意见