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taliayoung

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】请问Gaussian在优化过程中可以固定某两个分子不动吗? 已有5人参与

RT,需要在计算过程中保证某两个分子中某两个原子的距离固定不变

请问如何实现?加入什么参数?菜鸟拜谢。。。

[ Last edited by taliayoung on 2010-9-13 at 19:13 ]
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manson1998

金虫 (著名写手)

OLED达人

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zhou2009(金币+2): 2010-09-13 16:31:27
看你怎么定义两个分子间的距离了。你可以设定分子A内的a原子到分子B内的b原子的距离为分子A和B的距离,那么你只需要固定a和b原子的距离就可以了。如果有其他的需求,可以通过设虚原子的方式来进行。看你个人的需要了。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

惺惺相惜情不自禁
2楼2010-09-13 15:42:41
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ifmc1234

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by taliayoung at 2010-09-13 15:34:08:
RT,需要在计算过程中保证某两个分子间的距离固定不变

请问是否可能?如何实现呢?

可以采用内坐标优化,固定那两的距离。不过有时候得在molden里重新建一下模型。
3楼2010-09-13 17:59:06
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taliayoung

新虫 (初入文坛)

可以讲得具体点么。。。我确实只是需要固定其中两个原子的距离就行了,在gv中如何实现?还是需要加入什么参数?谢谢!!!
4楼2010-09-13 19:13:00
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taliayoung

新虫 (初入文坛)

有人可以回复我一下么。。。
5楼2010-09-20 09:36:21
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manson1998

金虫 (著名写手)

OLED达人


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by taliayoung at 2010-09-20 09:36:21:
有人可以回复我一下么。。。

菜单上有edit选项---下拉有个redundant选项--然后对象键角,二面角,键长啊等等-选择行为 固定啊,扫描啊等等-然后save一下就可以了
惺惺相惜情不自禁
6楼2010-09-20 09:47:28
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wanggy789

禁虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
送鲜花一朵
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7楼2013-04-01 22:04:15
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manson1998

金虫 (著名写手)

OLED达人

引用回帖:
2421879楼: Originally posted by wanggy789 at 2013-04-01 22:04:15
那如何固定a原子和b原子的距离呢?
或者说在建输入文件时加什么关键词?还是设置什么参数?...

有个freeze吧
惺惺相惜情不自禁
8楼2013-04-02 13:16:59
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silverlhy

铜虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
输入原子序号,冻结原子即可

1.jpg

9楼2013-04-02 21:33:49
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