应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 【求助】VMD显示轨迹文件会出现很多线
31/1返回列表
查看: 2290  |  回复: 2
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

shengxiang

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】VMD显示轨迹文件会出现很多线

用VMD显示轨迹文件的时候，轨迹文件正常，但是这个过程中有很多从一个边到另外一个边的线，我的理解是周期边界条件的原因，将一个键上的两个原子用一个横跨整个图像的线连起来了，不知道这样理解是否正确，如果不正确的话正确的理解应该是什么呢？怎么样才能消除这种效果，也就是在显示的时候去掉周期边界条件，望不吝赐教~
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-09-08 15:43:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaorongwei

金虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
1楼: Originally posted by shengxiang at 2010-09-08 15:43:22:
用VMD显示轨迹文件的时候，轨迹文件正常，但是这个过程中有很多从一个边到另外一个边的线，我的理解是周期边界条件的原因，将一个键上的两个原子用一个横跨整个图像的线连起来了，不知道这样理解是否正确，如果不 ...

两个原子之间的距离很近时，vmd显示时会出现线条，不知道你的是不是这样的情况。
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-10-07 16:57:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

winterz

木虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
shengxiang(金币+10): 好的 谢谢 2011-10-08 08:21:37
Graphics-->Representations-->Drawing Method-->DynamicBonds
赞一下(3人) 回复此楼
3楼2011-10-07 17:27:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 shengxiang 的主题更新
31/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 5/250 2026-11-12 02:45 by 9fOTqj074tIg
[基金申请] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 5/250 2026-11-12 02:36 by 9fOTqj074tIg
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 3/150 2026-11-12 02:34 by 9fOTqj074tIg
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 czAiolzR0IJC 2026-11-10 6/300 2026-11-12 02:12 by 9fOTqj074tIg
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 5/250 2026-11-12 02:01 by 9fOTqj074tIg
[基金申请] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 5/250 2026-11-12 01:52 by 9fOTqj074tIg
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 4/200 2026-11-12 01:30 by 9fOTqj074tIg
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 3/150 2026-11-12 01:28 by 9fOTqj074tIg
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 YHiw1gou1Eda 2026-11-10 6/300 2026-11-12 01:14 by 9fOTqj074tIg
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 FChKX8meu1ds 2026-11-09 7/350 2026-11-12 01:06 by 9fOTqj074tIg
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 FChKX8meu1ds 2026-11-09 6/300 2026-11-12 01:06 by 9fOTqj074tIg
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 FChKX8meu1ds 2026-11-09 8/400 2026-11-12 00:55 by 9fOTqj074tIg
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 FChKX8meu1ds 2026-11-09 10/500 2026-11-12 00:46 by 9fOTqj074tIg
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +7 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 10/500 2026-11-12 00:35 by 9fOTqj074tIg
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 7/350 2026-11-12 00:33 by 9fOTqj074tIg
[硕博家园] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +6 0TEMgxdT1eIw 2026-11-09 8/400 2026-11-12 00:33 by 9fOTqj074tIg
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 4/200 2026-11-11 17:53 by TgvkbZZl9tqB
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 6/300 2026-11-11 16:47 by TgvkbZZl9tqB
[考博] 27博士 +3 锦鲤送福至 2026-11-10 3/150 2026-11-11 15:53 by 可淡不可忘
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-09 00:14 by l48hFd8Nwae2
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭