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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 【求助】VMD显示轨迹文件会出现很多线
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shengxiang

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】VMD显示轨迹文件会出现很多线

用VMD显示轨迹文件的时候，轨迹文件正常，但是这个过程中有很多从一个边到另外一个边的线，我的理解是周期边界条件的原因，将一个键上的两个原子用一个横跨整个图像的线连起来了，不知道这样理解是否正确，如果不正确的话正确的理解应该是什么呢？怎么样才能消除这种效果，也就是在显示的时候去掉周期边界条件，望不吝赐教~
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1楼 2010-09-08 15:43:22
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xiaorongwei

金虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
1楼: Originally posted by shengxiang at 2010-09-08 15:43:22:
用VMD显示轨迹文件的时候，轨迹文件正常，但是这个过程中有很多从一个边到另外一个边的线，我的理解是周期边界条件的原因，将一个键上的两个原子用一个横跨整个图像的线连起来了，不知道这样理解是否正确，如果不 ...

两个原子之间的距离很近时，vmd显示时会出现线条，不知道你的是不是这样的情况。
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2楼2011-10-07 16:57:04
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winterz

木虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
shengxiang(金币+10): 好的 谢谢 2011-10-08 08:21:37
Graphics-->Representations-->Drawing Method-->DynamicBonds
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3楼2011-10-07 17:27:02
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