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低调先生

铁杆木虫 (小有名气)

还是那么菜

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[交流] 【求助】怎样固定原子和距离已有5人参与

%chk=123.chk
%nproc=4

#P B3LYP/6-31G OPT FREQ

123

0 1
C                -1.75862064 0.14655164 0.00000000
H                -1.40196638 -0.86225842 -0.00000000
H                -1.40194777 0.65095009 0.87365134
H                -1.40194777 0.65095009 -0.87365134
H                -2.82862064 0.14656479 0.00000000
X                2.23911803 2.15013925 -2.31352296

1 2 1.0 3 1.0 4 1.0 5 1.0
2
3
4
5

这是gaussian计算输入文件。我想知道怎样固定原子“X”，和固定“X”与“C”之间的距离，在这里面怎么设置命令才能到达那种效果，请高手指点，小弟在此谢过了！

回复此楼

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不停的学习

1楼2010-09-08 09:58:10

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

meteoric30

木虫 (正式写手)

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低调先生(金币+10): 2010-09-08 12:04:37

引用回帖:

Originally posted by 低调先生 at 2010-09-08 11:26:41:

固定某一个原子你知道怎么设置吗？
那个距离5.03475怎么算出来的？还是你举的一个例子？

5.03475是你给的原子之间的距离
固定一个一个原子
%chk=123.chk
%nproc=4

#P B3LYP/6-31G OPT FREQ

123

0 1
C                -1.75862064 0.14655164 0.00000000
H                -1.40196638 -0.86225842 -0.00000000
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H                -1.40194777 0.65095009 -0.87365134
H                -2.82862064 0.14656479 0.00000000
X                2.23911803 2.15013925 -2.31352296

x 原子序号 f

看你固定那个原子了，就是那个原子的原子序号