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shengxiang

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】势能为正值

请教个问题,跑完动力学之后我用e_energy分析势能随时间的变化时发现势能都是正的,这怎么解释啊?

势能图如下:
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043114076

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
ghcacj(金币+5):谢谢 2010-09-04 12:10:57
shengxiang(金币+2): 2010-09-05 08:28:43
引用回帖:
Originally posted by shengxiang at 2010-09-03 21:41:15:



感谢你的回复,那个帖子我看了,如果势能出现负值的话我认为是正确的,因为取无穷远处和真空为势能零点,但是出现正值的话我真不知道该怎么解释了,望帮助~

对于分子力学来说,能量各部分的0点定义是不一样的。对于谐振势,键长键角0点都是在平衡位置,而且能量一定不会小于0. 库仑势能的0点是无穷远处,能量一定是负值。LJ VDW势除了无穷远处的0点外在r0的位置还有一个零点,当原子距离小于r0时能量大于0,大于r0时能量为负。
总的势能是这几项的加和,能量可能大于0也可能小于0,特别是当分子构型扭曲比较厉害时,成键能贡献很大。
9楼2010-09-04 11:25:49
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查看全部 17 个回答

345320587

银虫 (初入文坛)


lei0736(金币+1):谢谢 2010-09-02 19:46:09
shengxiang(金币+5): 2010-09-03 21:36:01
你跑的是个什么体系?我从前跑过肽段,得到的势能也是正值,是没有问题的 不过看你的势能值貌似也太高了点了啊 是不是计算方面有什么错误呢~
2楼2010-09-02 16:37:45
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yahoohoo

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
lei0736(金币+2):谢谢 2010-09-02 19:46:16
shengxiang(金币+5): 2010-09-03 21:36:08
引用回帖:
Originally posted by shengxiang at 2010-09-02 10:45:00:
请教个问题,跑完动力学之后我用e_energy分析势能随时间的变化时发现势能都是正的,这怎么解释啊?

你可以先考虑下这个问题:

势能为什么不能是正的?

然后是:

你模拟的体系中势能由哪些部分组成?
3楼2010-09-02 17:23:27
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043114076

木虫 (正式写手)

★ ★
lei0736(金币+2):谢谢 2010-09-02 22:10:43
shengxiang(金币+1): 2010-09-03 21:36:13
4楼2010-09-02 20:32:45
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