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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】Gulp中的几何优化，MD等和Dmol3的中的有什么区别？
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麒麟半仙

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】Gulp中的几何优化，MD等和Dmol3的中的有什么区别？已有7人参与

本来一直在课题组里做Dmol3的计算，对Dmol3还算比较熟悉。知道它也是能算分子动力学的。曾尝试用它的动力学算过一些体系，计算速度很慢很慢，而且结果都是在30个circle左右就算死了，显示原因是恒温器中产生了不稳定，需重设恒温器。
     后来在老师的要求下，在学Gulp，发现里面也有几何优化，能量，动力学等功能。
    感觉Dmol3 中的动力学 是 基于第一原理的，而Gulp 中是基于经典力学的。不知这样理解对不对？
    但是又搞不清楚Gulp 是怎么用经典力学计算体系能量的？好像这个问题书上没有说过。
    看了些分子动力学的书，感觉分子动力学要计算能量还是要用第一原理的方法的。这样是不是说Dmol3和Gulp在做体系能量和几何优化时的原理是一样的呢？
    望高手解答！！

[ Last edited by 麒麟半仙 on 2010-9-1 at 00:30 ]
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神啊，让我成仙吧。
1楼2010-09-01 00:25:35
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ym23

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2楼2010-09-01 08:38:00
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zyj8119

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GULP怎么拟合小分子的力场参数呢？
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好好学习，天天向上。
3楼2010-09-01 10:36:49
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txf8378

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aylayl08(金币+1):谢谢探讨 2010-09-01 13:20:36
gulp所用到的势是经验势，经验势是通过物质有关参数的试验值或从头计算拟合而得到的，精确度要比从头计算要差
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4楼2010-09-01 12:46:59
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fzx2008

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zzy870720z(金币+1):谢谢补充 2010-09-01 17:19:03
补充楼上，gulp是经验方法，计算速度比第一性原理快，精确程度依赖势参数的选择！
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5楼2010-09-01 13:38:10
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麒麟半仙

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by txf8378 at 2010-09-01 12:46:59:
gulp所用到的势是经验势，经验势是通过物质有关参数的试验值或从头计算拟合而得到的，精确度要比从头计算要差

明白了，非常感谢！
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神啊，让我成仙吧。
6楼2010-09-01 16:50:22
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ym23

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sunyang1988(金币+1):谢谢交流 2010-12-08 16:43:23
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Originally posted by zyj8119 at 2010-09-01 10:36:49:
GULP怎么拟合小分子的力场参数呢？

gulp拟合有自己方法，帮助文件里有力场拟合的例子，但是个人感觉拟合的效果不好，要自己想办法做出势参数和力场来
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7楼2010-12-08 16:33:59
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zyj8119

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by ym23 at 2010-12-08 16:33:59:


gulp拟合有自己方法，帮助文件里有力场拟合的例子，但是个人感觉拟合的效果不好，要自己想办法做出势参数和力场来

你做过吗？貌似很多人说在LINUX下的GULP用起来更舒服。。
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好好学习，天天向上。
8楼2010-12-08 17:34:40
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ym23

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我ＧＵＬＰ用的不熟，但是我现在专门做势参数
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博观约取、厚积薄发---壁立千仞、无欲则刚
9楼2010-12-08 20:12:08
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liujuan8704

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Originally posted by ym23 at 2010-12-08 20:12:08:
我ＧＵＬＰ用的不熟，但是我现在专门做势参数

大侠好 ，你一直在做势函数  那请问大侠有哪些势函数的参数啊
能不能教教我到哪里查出Mn与C的势函数啊
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10楼2011-01-03 14:54:43
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