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麒麟半仙木虫 (小有名气)
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【求助】Gulp中的几何优化，MD等和Dmol3的中的有什么区别？ 已有7人参与
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本来一直在课题组里做Dmol3的计算，对Dmol3还算比较熟悉。知道它也是能算分子动力学的。曾尝试用它的动力学算过一些体系，计算速度很慢很慢，而且结果都是在30个circle左右就算死了，显示原因是恒温器中产生了不稳定，需重设恒温器。 后来在老师的要求下，在学Gulp，发现里面也有几何优化，能量，动力学等功能。 感觉Dmol3 中的动力学 是 基于第一原理的，而Gulp 中是基于经典力学的。不知这样理解对不对？ 但是又搞不清楚Gulp 是怎么用经典力学计算体系能量的？好像这个问题书上没有说过。 看了些分子动力学的书，感觉分子动力学要计算能量还是要用第一原理的方法的。这样是不是说Dmol3和Gulp在做体系能量和几何优化时的原理是一样的呢？ 望高手解答！！ [ Last edited by 麒麟半仙 on 2010-9-1 at 00:30 ] |
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