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x7511413

金虫 (正式写手)

科研小菜

[交流] 【求助】mpw1pw91和b3lyp方法的比较 已有2人参与

各位专家、各位虫友:你们好!
      小弟我刚接触G3,对其方法不是很了解,故发帖求助。我想知道mpw1pw91和b3lyp两种方法的比较。比如他们计算相同体系的时间长短、计算的准确性,他们各适合怎样的体系? 例如:我想优化环糊精分子(大概100多个原子,只含C、H、O),用mpw1pw91/6-31G还是用b3lyp/6-31G?特别是耗时我想要知道得详细点,是快几天还是几小时?我知道b3lyp/6-31G优化环糊精好像要很久,一般都是用半经验PM3,以上两种方法比半经验还是准确些吧?
          我们实验室的电脑配置都是:单核,1G内存,而且用的是WINDOWS系统,没办法只有这个条件,而且老板还一直叫我们要用 从头算 选择高基组,我们实在是崩溃,只有浪费我们宝贵的时间来换取高精度了。
                     在此感谢各位的回帖
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哦也
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

x7511413(金币+3): 2010-08-22 18:42:26
引用回帖:
Originally posted by x7511413 at 2010-08-18 19:05:33:

您好!请问初始构型不是在晶体数据库中搞的吗? 算上中断的大概多久呢?呵呵 谢谢啦

用晶体数据得到的初始结构并不优秀。你这个配置……jiewei先生说用mp2实在是强你所难。hgga对你的机器来说鸭梨很大,gga嘛鸭梨其实也不小哦……你问问boss让你用lda不。其实吧你这个最好还是用win的ms的dmol3的lda啦,基组就选dnd就好啦,这个鸭梨就不是太大咯否则很容易杯具滴……反正盗版ms满天飞,你随便下载一个就是咯……你老板说让你用从头算,你就告诉他dmol3也是从头算(不是骗你哦,dmol3确实是从头算,是最快的从头算)

如果我是你,面对这种条件,我会用pm3或pm6优化,dmol3单点。

扯了这么多差点忘了你的问题。直接回答你的问题好啦。你问mpw1pw91和b3lyp优化谁更好?我说,既然你的体系只含有C、H、O,那么b3lyp做优化那就是极好!但是基组不要选6-31g。要我说,基组选6-31+g*。因为体系含有O(强烈的负电中心),所以需要加弥散。事实上,只含有C、H、O的体系,gga并不差,尤其是blyp,完全可以替代b3lyp搞优化

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-8-20 at 14:57 ]
15楼2010-08-20 14:45:24
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普通回帖

linzhongaiguo

铜虫 (正式写手)

不要优化他,直接下载结构

不要优化他,直接下载结构
本文来自: 小木虫论坛 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2308451&fpage=1
DFT
2楼2010-08-18 08:57:01
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ghcacj

荣誉版主 (著名写手)

阿超

优秀版主


heyo_123(金币+1):鼓励交流!! 2010-08-18 09:22:08
单核,1G内存,而且用的是WINDOWS系统??
这个也来做量化?太夸张了,个人感觉体系这么大,半经验的方法就可以了,以前我也看人用过分子力学的方法计算过的。
3楼2010-08-18 09:13:37
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x7511413

金虫 (正式写手)

科研小菜

引用回帖:
Originally posted by ghcacj at 2010-08-18 09:13:37:
单核,1G内存,而且用的是WINDOWS系统??
这个也来做量化?太夸张了,个人感觉体系这么大,半经验的方法就可以了,以前我也看人用过分子力学的方法计算过的。

谢谢哦   呵呵 没有办法哦 老板要求高级方法 这样才能发个好点的文章哦。半经验和UFF见的比较多,可是他们选的体系都非常的前沿 所以才能好点的文章哦  我们就惨啦
哦也
4楼2010-08-18 10:24:30
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x7511413

金虫 (正式写手)

科研小菜

引用回帖:
Originally posted by linzhongaiguo at 2010-08-18 08:57:01:
不要优化他,直接下载结构
本文来自: 小木虫论坛 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2308451&fpage=1

谢谢哦 这样不行的哦 我们必须自己优化  下载的只是晶体数据库的吧 不是最稳定的构象哦
哦也
5楼2010-08-18 10:25:54
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ghcacj

荣誉版主 (著名写手)

阿超

优秀版主


heyo_123(金币+1):鼓励交流!! 2010-08-18 11:55:50
引用回帖:
Originally posted by x7511413 at 2010-08-18 10:24:30:

       谢谢哦   呵呵 没有办法哦 老板要求高级方法 这样才能发个好点的文章哦。半经验和UFF见的比较多,可是他们选的体系都非常的前沿 所以才能好点的文章哦  我们就惨啦

可是做这个体系,这种配置几乎是不可能完成的任务,个人建议不如将这台机器做成Linux系统,用Orca,计算起来速度会快不少。用法和Gaussian差不多。
6楼2010-08-18 10:33:52
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家


heyo_123(金币+1):鼓励交流!! 2010-08-18 11:55:58
x7511413(金币+1): 2010-08-22 18:41:31
不要用杂化泛函。对于关联能不是很强的一般体系,纯GGA已经足够了。Gaussian的纯GGA加上密度拟合基组,算100个原子以下的体系没问题。如果有对称性,速度会更快。
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
7楼2010-08-18 10:58:54
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heyo_123

至尊木虫 (职业作家)

引用回帖:
Originally posted by x7511413 at 2010-08-18 10:24:30:

       谢谢哦   呵呵 没有办法哦 老板要求高级方法 这样才能发个好点的文章哦。半经验和UFF见的比较多,可是他们选的体系都非常的前沿 所以才能好点的文章哦  我们就惨啦

兄弟!!你的这配置,在windows条件下,该大小的体系不太好算呀!!
可能会悲剧!!建议找个配置高的机子!!
8楼2010-08-18 11:57:43
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gyli

木虫 (小有名气)

~~~~

我用B3LYP优化过,不过基组用的大得多。
8G内存,4核,linux系统,560多次SCF才收敛(这与初始构型有很大关系)。
因为中间断了几次,不好估计时间。
Gravitation cannot be held responsible for people falling in love.
9楼2010-08-18 12:18:01
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jiewei

专家顾问 (著名写手)

小才


heyo_123(金币+1):呵呵··· 2010-08-18 16:02:37
x7511413(金币+1): 2010-08-22 18:41:00
要么用上述某位童鞋说的 GGA ,要么就MP2吧.  至于初试结构,你有单晶么? 有单晶数据可以用单晶的分子构型先放CHEM3D里面优化下,然后放高斯算吧. 没有单晶你最好就在C3D里面找个好的构型然后再算吧.
至于时间,我不是做这个的,无法提供帮助.抱歉

还有我实在对楼主的电脑表示遗憾,作为一个鸭梨,它真的好大.
我想做个科学家,可我又喜欢写诗;我想做一个诗人,可我却读的理工科..
10楼2010-08-18 13:57:43
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