应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 请帮忙看看我计算HOMO LUMO是否正确，谢谢！
91/1返回列表
查看: 1803  |  回复: 8
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

xuzhj01

金虫 (小有名气)

[交流] 请帮忙看看我计算HOMO LUMO是否正确，谢谢！已有3人参与

要求：

一、The ground-state geometries of the protonated dyes have been optimized in the gas phase by DFT with the Gaussian09 package,  using the hybrid B3LYP  functional and the standard 6-31G(d) basis set.

二、Thecalculations were performed with MPW1K functional and 6-31+G(d) basis set on the B3LYP optimized ground-state geometries. Solvation effect were included in the TDDFT calculations in CH2Cl2 with the nonequilibrium version of the C-PCM model.


计划流程：
1： 在chemdraw中画出需要计算的分子
2： 导入CHEM3D 进行基本的MMP2能量优化，得到最优构象，转成Z坐标
3、按照第一步优化，
4、准备Gaussian输入文件（对应以上第二步计算）

第一步输入文件如下：
%mem=1GB
%chk=D:\DSSC\calHOMO.chk
# opt b3lyp/6-31g(d) geom=connectivity

calHOMO

0 1


第二步输入文件如下：

%mem=1GB
%chk=D:\DSSC\calHOMO.chk
# opt freq mpw1pw91/6-31g(d) scrf=(cpcm,solvent=dichloromethane)
geom=connectivity

calHOMO

0 1
×××××××分子坐标


请大家帮忙看看，这样的过程是否正确，谢谢

[ Last edited by xuzhj01 on 2011-5-19 at 10:41 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼2011-05-19 10:32:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
gmy1990(金币+1): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-05-19 12:50:52
如果这是作业题的话，你最多得20分；
如果这是科研的话，也就是0分。
呵呵。。你刚入门吧，建议你练习3个月的基础，再来上手做吧。。
你缺少的知识太多了。一个帖子回答不完的。
赞一下(2人) 回复此楼
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
2楼2011-05-19 10:41:35
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xuzhj01

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zhangmt at 2011-05-19 10:41:35:
如果这是作业题的话，你最多得20分；
如果这是科研的话，也就是0分。
呵呵。。你刚入门吧，建议你练习3个月的基础，再来上手做吧。。
你缺少的知识太多了。一个帖子回答不完的。

每个人都是从0开始的，你难道不是？


实践才能对理论有更深的了解。

比较厌烦你这样不愿回答又故作高深的人。
赞一下 回复此楼
3楼2011-05-19 10:48:30
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mchen10

金虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
cenwanglai(金币+2): 也是可爱的人 2011-05-19 12:17:48
gmy1990(金币+1): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-05-19 12:51:29
楼主莫动气，二楼也是一片好意，只是告诉里，纸上得来终觉浅。
为什么不先试着运行一下，出了问题再提出来问呢？自己运行过的和别人告诉你的，可能结果是一样的，收获却有多有少。

其次，在坛子里提问要有针对性，要把问题描述得清楚。

如方说，你可以说：“这个计算是用xx方法算yy性质，以下是我的计算流程，其中的XX部分我不是很有把握，请大家帮我看看。” 太笼统的问题，人看到了就算是有心帮你，也不知道怎么答了。
赞一下(3人) 回复此楼
更痛苦的是梦没醒路已经不能走了
4楼2011-05-19 11:02:24
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xuzhj01

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by mchen10 at 2011-05-19 11:02:24:
楼主莫动气，二楼也是一片好意，只是告诉里，纸上得来终觉浅。
为什么不先试着运行一下，出了问题再提出来问呢？自己运行过的和别人告诉你的，可能结果是一样的，收获却有多有少。

其次，在坛子里提 ...

呵呵 谢谢提醒，我以前是做生物大分子的，基本上没有接触量子化学方面；

现在想学习一下，可能是我接触少表达不清。

不知道这样是否正确：

要求是计算一个新分子的HOMO以及LUMO轨道，计算他的跃迁能量，以此判断分子的电子迁移能力。

文献的上的描述 应该是先优化结构  然后再计算它的HOMO以及LUMO能量

我也是按照手册来做的这个计算，就是不知道一些参数设置是否正确。

我学新的东西希望先动手，然后再看书，我觉得这样好理解理论，可能每个人不一样。
赞一下 回复此楼
5楼2011-05-19 11:15:57
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
cenwanglai(金币+2): 可爱的人 2011-05-19 12:17:27
我没有轻视你的意思，如果你觉得受侮辱了，也许是我说的方式让你误会了。抱歉。
我只是想明确地告诉你:
基于你现在的基础，这不是你目前就能胜任的工作，你应该先熟悉3个月以后再回头看这个问题。
你现在想做，想法是好的，但是除非有人在旁边手把手地教你，你是不可能马上上手的。这不该是你的问题，你应该跟你的导师谈——至少目前你做不到，需要你的导师。
赞一下(2人) 回复此楼
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
6楼2011-05-19 11:21:23
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xuzhj01

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zhangmt at 2011-05-19 11:21:23:
我没有轻视你的意思，如果你觉得受侮辱了，也许是我说的方式让你误会了。抱歉。
我只是想明确地告诉你:
基于你现在的基础，这不是你目前就能胜任的工作，你应该先熟悉3个月以后再回头看这个问题。
你现在想做， ...

呵呵 这个学习问题以后再讨论吧

我已经毕业了，好多TX都是做生物大分子的，所以求助于论坛了。



对你码这么多字表示感谢！
赞一下 回复此楼
7楼2011-05-19 11:41:57
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
gmy1990(金币+3): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-05-19 15:53:54
简单地说一下我的看法吧：

画分子用GView就可以了。
计算过程：

%chk=calHOMO.chk
%mem=6GB
%nprocs=4
#p opt b3lyp/6-31g(d)

title

1 2
所有原子初始坐标

--link1--
%chk=calHOMO.chk
#p freq(noraman) b3lyp/6-31g(d) geom=check guess=read

title

1 2

--link1--
%chk=calHOMO.chk
#p mpw1pw91/6-31+g(d) td(nstate=20) geom=check guess=read scrf=(cpcm,solvent=dichloromethane)

title

1 2

--link1--
%chk=calHOMO.chk
#p mpw1pw91/6-31+G(d) SCRF=(cpcm,solvent=dichloromethane,Read) Geom=Check Guess=Read

title

1 2

NonEq=write

--link1--
%chk=calHOMO.chk
#p mpw1pw91/6-31+G(d) TD(NStates=20,Root=1) SCRF=(cpcm,solvent=dichloromethane,ExternalIteration, Read) Geom=Check Guess=Read

title

1 2

NonEq=read


以上仅为个人猜测，应该不会太离谱。总的计算，如果有个好点的机器，一个星期能拿出结果，虽然说是这么说，但做起来，如果没有人指导，3个月能做出来，你就是神童了。我本以为是你导师给的题目，所以感觉好像导师不太负责任的意思。不给指导，自学几乎是做不了的。

[ Last edited by zhangmt on 2011-5-19 at 15:15 ]
赞一下(2人) 回复此楼
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
8楼2011-05-19 15:13:35
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

damihu2011

银虫 (职业作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
36615楼: Originally posted by zhangmt at 2011-05-19 15:13:35
简单地说一下我的看法吧：

画分子用GView就可以了。
计算过程：

%chk=calHOMO.chk
%mem=6GB
%nprocs=4
#p opt b3lyp/6-31g(d)

title

1 2
所有原子初始坐标

--link1--
%chk=calHOMO.chk
#p f ...

请问计算HOMO以及LUMO轨道，可以分析构型的那些性质？？除了跃迁，光学性之外？能不能有相关导电的分析呢？？
赞一下 回复此楼
我的眼里只有苯环
9楼2013-02-28 19:54:36
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xuzhj01 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复(可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭