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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【讨论】对并行计算参数设置的讨论
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gleerat

木虫 (正式写手)

[交流] 【讨论】对并行计算参数设置的讨论 已有2人参与

1、在说明书上写的关于NPAR的“计算节点数”，应该是计算时所使用的进程数吧。（当我使用N个进程时， 提示：running on    N nodes）；
2、NPAR的设置规则是：取值为1时（适用于胖节点），一个节点计算一个带；取值为N时，N/NPAR个节点上计算一个带。那么当N为节点数时，除了节点内存和通讯的考虑之外，NPAR＝1就作用应该跟NPAR＝N是一样的了，对么？说明书上说对于Linux系统来说，NPAR＝number of nodes时效果最好，那么对于单机并行（4GB内存）或者单节点计算的话，NPAR设置为节点数N和1是一样的。（因为第一个问题的原因，我把NPAR设置的节点数N默认为进程数）；
3、在计算态密度时，要求得到分轨道投影，这时需要设置NPAR＝1、LORBIT＝11，这么说来态密度计算比其他计算时对节点内存的压力要大；
4、对于单机并行或者单节点计算，NPAR＝M（M>进程数）与NPAR＝1或者NPAR＝N（N＝进程数），哪一个计算速度更高些（在内存充足的情况下）？我现在使用NPAR＝1，内存使用为<1.3GB，机器共有3.9GB内存、四核英特尔，但是我的问题不仅限于我目前的单机；
5、在说明书上提到不同的算法（RMM-DIIS、CG）对NPAR的影响，但是推荐设置中并未提到算法的影响，这是为什么？同理，LPLANE也如此。
6、关于NSIM的用法，说明书上没有细说，只是指明了对于linux系统推荐使用NSIM＝4。不过也见过有人专门作测试优化的。不知道谁是否可以提供一些见解。http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp-forum/forum_viewtopic.php?4.7257。

[ Last edited by gleerat on 2010-8-15 at 10:34 ]
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明察、慎思、笃行
1楼 2010-08-14 22:25:54
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calos818

木虫 (著名写手)

新人菜鸟
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by gleerat at 2010-08-14 22:25:54:
1、在说明书上写的关于NPAR的“计算节点数”，应该是计算时所使用的进程数吧。（当我使用N个进程时， 提示：running on    N nodes）；
2、NPAR的设置规则是：取值为1时（适用于胖节点），一个节点计算一个带；取 ...

这些参数我不设置，采用默认的1个节点8核心来计算，请问设置这些参数能提高计算效率么
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2楼2010-08-15 07:49:07
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gleerat

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by calos818 at 2010-08-15 07:49:07:

这些参数我不设置，采用默认的1个节点8核心来计算，请问设置这些参数能提高计算效率么

NPAR默认为1，NSIM默认为4，也有很多人不设置并行参数而使用默认值。但是设置了并行参数的话，会提高计算效率的。建议你看看说明书的Parallelisation: NPAR switch, and LPLANE switch一节和NSIM - tag 一节，或者http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp ... tag_LPLANE_tag.html和http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp/vasp/NSIM_tag.html

[ Last edited by gleerat on 2010-8-15 at 10:42 ]
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明察、慎思、笃行
3楼2010-08-15 10:30:47
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