应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 如何控制内存需求
131/1返回列表
查看: 2684  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

nkleof

银虫 (正式写手)

[交流] 如何控制内存需求

在计算能带时，发现内存需求过大。一个124个原子的超晶胞已经超出了48G（节点的最大内存），感觉不太正常，请问怎么通过一些设置来控制一下内存需求？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-06-17 16:23:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

uuv2010

荣誉版主 (职业作家)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
nkleof(金币+1): 谢谢讨论！ 2011-06-17 16:51:05
zzy870720z(金币+1): 鼓励交流 2011-06-22 10:05:53
设置如下参数据说可以节省内存：
ISYM=0
NPAR=1
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2011-06-17 16:35:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nkleof

银虫 (正式写手)
★ ★
zzy870720z(金币+2): 谢谢指教 2011-06-22 10:06:12
引用回帖:
Originally posted by uuv2010 at 2011-06-17 16:35:52:
设置如下参数据说可以节省内存：
ISYM=0
NPAR=1

谢谢建议，NPAR应该是可以节省内存的，每次只计算一条能带。不过ISYM=0是不利用对称性，这应该是很费内存的。
我在INCAR里已经设置了NPAR=1，NSIM=1，结果和这两个标签都大于1的情况没什么变化，内存需求并没降低。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-06-17 16:50:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

06022043

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
nkleof(金币+2): 谢谢建议！ 2011-06-17 18:14:41
是不是应该减少K点呢。毕竟原子比较多。
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2011-06-17 17:46:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nkleof

银虫 (正式写手)
计算能带的时候，采用line模式，这种情况下k点的数量和内存会有关系吗，求澄清。我觉得如果是一个一个k点算的话，应该不会对内存有影响。
赞一下 回复此楼
6楼2011-06-17 18:16:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

uuv2010

荣誉版主 (职业作家)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
mazuju028(金币+1): 谢谢交流 2011-06-19 09:33:17
引用回帖:
Originally posted by nkleof at 2011-06-17 16:50:45:
谢谢建议，NPAR应该是可以节省内存的，每次只计算一条能带。不过ISYM=0是不利用对称性，这应该是很费内存的。
我在INCAR里已经设置了NPAR=1，NSIM=1，结果和这两个标签都大于1的情况没什么变化，内存需求并没 ...

vasp手册上是这么说明ISYM的：
Switch of symmetrisation (ISYM=0). Symmetrisation is done locally on each node requiring three huge arrays. VASP.4.4.2 (and newer versions) have a switch to run a more memory conserving symmetrization. This can be selected by specifying ISYM=2. Results might however differ somewhat from ISYM=1 (usually only 1/100th of an meV).
赞一下(2人) 回复此楼
7楼2011-06-17 18:38:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nkleof

银虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by uuv2010 at 2011-06-17 18:38:54:
vasp手册上是这么说明ISYM的：
Switch of symmetrisation (ISYM=0). Symmetrisation is done locally on each node requiring three huge arrays. VASP.4.4.2 (and newer versions) have a switch to run  ...

对啊，如果采用ISYM=2的话，利用原胞的对称性，就会节省很多内存。采用ISYM=0的话，就放开对称性，每个原子都需要进行计算，内存消耗就会大很多。
赞一下 回复此楼
8楼2011-06-21 23:13:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

贺仪

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
zzy870720z(金币+2): 谢谢指教 2011-06-22 10:06:42
nkleof(金币+5): 非常感谢，这个建议是很有效的。 2011-06-22 17:07:24
用line模式的话，k点的数目对内存影响特别大。你可以几个几个算一次，然后连起来。
总的来说与内存相关的有k点，还有你的grid（一般通过PREC这个来控制的，也可以改变NXG等），另外对line模式与并行计算的核成正比，其他情况并行的话内存增加的不多
赞一下(2人) 回复此楼
9楼2011-06-22 09:29:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dxcharlary

专家顾问 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
124个原子，你用了多少k点，估计3*3*3都很难承受得了。
赞一下(1人) 回复此楼
10楼2011-06-22 11:48:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

贺仪

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by dxcharlary at 2011-06-22 11:48:46:
124个原子，你用了多少k点，估计3*3*3都很难承受得了。

我算过168个原子的体系，也是并行的，内存是64G的但是还没用完，我对每个路径算一次，每个路径算的时候取20个k点，分开算是没任何问题的
赞一下(1人) 回复此楼
11楼2011-06-22 14:05:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

uuv2010

荣誉版主 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by dxcharlary at 2011-06-22 11:48:46:
124个原子，你用了多少k点，估计3*3*3都很难承受得了。

vasp的并行效率很高，如果有cpu够多的话，1000的原子也可以。
机器空闲的时候测试过。
赞一下(1人) 回复此楼
12楼2011-06-22 14:24:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nkleof

银虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by dxcharlary at 2011-06-22 11:48:46:
124个原子，你用了多少k点，估计3*3*3都很难承受得了。

做静态计算的时候，用了6*6*6的网格。
赞一下 回复此楼
13楼2011-06-22 17:08:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
7614792353楼
2011-06-17 16:43   回复  
相关版块跳转 我要订阅楼主 nkleof 的主题更新
131/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭