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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 【求助】分子模拟总能量是否一定小于0？
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043114076

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】分子模拟总能量是否一定小于0？ 已有6人参与

使用DL_POLY2模拟一个晶体体系，发现总能量大于0，其他库仑能、范德华能和CFG能量都小于0 。不知这是否正常。
模拟使用NPT系综，温度100K。
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1楼 2010-08-13 14:24:54
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manutdhk

木虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+5):谢谢 2010-08-13 15:20:10
引用回帖:
Originally posted by 043114076 at 2010-08-13 14:24:54:
使用DL_POLY2模拟一个晶体体系，发现总能量大于0，其他库仑能、范德华能和CFG能量都小于0 。不知这是否正常。
模拟使用NPT系综，温度100K。

能量的绝对值没有多大的意义。因为能量是有参考点的。以氢原子的能量为例，其能量是电子与原子核的库仑能，零点是电子在无穷远处的时候都能量值。所为氢原子的基态能量是负值的，激发态的能量也是负值，但是绝对值比基态小。
当然，如果以氢原子的基态为能量参考点，那么所有激发态的能量都为正值，这时候的数值，一般称为激发能(excited energy).

同样道理，仅仅靠一个能量值去判断其是否合理，是不可能的，除非你有其他实验或者第一性原理的结果，（当然这些结果已经是以 上述真空时的能量为参考点亮，所以是负值的）作为参照。

一般的EAM势，都是以第一性原理或者实验结果为基础的。所以你算出的总能小于零，应该很正常。
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2楼2010-08-13 15:17:53
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043114076

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by manutdhk at 2010-08-13 15:17:53:



能量的绝对值没有多大的意义。因为能量是有参考点的。以氢原子的能量为例，其能量是电子与原子核的库仑能，零点是电子在无穷远处的时候都能量值。所为氢原子的基态能量是负值的，激发态的能量也是负值，但是 ...

谢谢了，尽管看不明白
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3楼2010-08-13 16:52:26
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-08-14 09:49:18
引用回帖:
Originally posted by 043114076 at 2010-08-13 16:52:26:
谢谢了，尽管看不明白

二楼讲解的十分准确全面，你真该好好理解一下
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4楼2010-08-13 17:28:12
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043114076

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by bay__gulf at 2010-08-13 17:28:12:

二楼讲解的十分准确全面，你真该好好理解一下

好的，谢谢指点
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5楼2010-08-13 20:12:15
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老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-08-17 16:14:16
总能量大于零？你能量的哪一项是大于零的呢？
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6楼2010-08-15 19:51:38
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043114076

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 老虎大王 at 2010-08-15 19:51:38:
总能量大于零？你能量的哪一项是大于零的呢？

除了VDW和库仑小于0，其他能量全都大于0，包括E_TOT
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7楼2010-08-16 10:11:26
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gromacs

银虫 (正式写手)
★ ★ ★
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lei0736(金币+2):谢谢 常来 2010-08-19 09:30:53
非键<0 成键能>0 成键能>非键 故总能>0 没什么不合理的
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"I was taught at school that you should never start a sentence without knowing the end of it." GROMACS讨论区：http://www.mdbbs.org/forum-39-1.html
8楼2010-08-16 19:36:46
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老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-08-17 16:14:29
引用回帖:
Originally posted by 043114076 at 2010-08-16 10:11:26:



除了VDW和库仑小于0，其他能量全都大于0，包括E_TOT

你可否费些事多打几个字，告诉我具体哪些能量大于零，哪些能量小于零，最好能有个数值。比如，你是否可以贴出OUTPUT里面最后一步的报告？
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9楼2010-08-16 20:55:42
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043114076

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by gromacs at 2010-08-16 19:36:46:
非键<0 成键能>0 成键能>非键 故总能>0 没什么不合理的

谢谢了
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10楼2010-08-17 08:23:20
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