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sqhnsd

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】RP-HPLC分离蛋白质样品遇到的奇怪现象 已有5人参与

本人最近在做RP-HPLC分离蛋白质
柱子:C8 孔径 300 A
A液: 98% 水     2% 乙腈 0.1% TFA
B液: 90% 乙腈  10%水   0.1% TFA
样本均为蛋白质复杂样本,每个组分大概包括50-100个左右的蛋白,只是分力量不同(楼下有图)
A-B: <20KD
C-H: 20-150 KD (c-h 分子量逐渐增大)
A-B图分离效果还可以接受,但是C-H分离效果很差,不知道原因,请高手指点。
另外,我考虑可能是蛋白质分离比较大 300 A的孔径可能不合适,但是我改用1000A的柱子效果也差不多是这样。请有相关方面经验的高手指教。
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皖山潜凤

银虫 (小有名气)


zxz.1982(金币+1):感谢交流 2010-08-13 15:04:29
引用回帖:
Originally posted by sqhnsd at 2010-08-09 09:48:58:
本人最近在做RP-HPLC分离蛋白质
柱子:C8 孔径 300 A
A液: 98% 水     2% 乙腈 0.1% TFA
B液: 90% 乙腈  10%水   0.1% TFA
样本均为蛋白质复杂样本,每个组分大概包括50-100个左右的蛋白,只是分力量不同( ...

看着图确实很怪异,  怎么都不到基线呢?
你为啥不用
A液: 100%水 0.1% TFA
B液: 100% 乙腈   0.1% TFA

这样的话,在乙腈达到100%的时候,一切疏水的冻洗都应该下来,如果还不回到基线,那就说明你的样品有问题, 没有那个分子的有那么强的疏水性质。



看你的这个图,感觉分辨率很低。  另外你为啥要在丙酮沉淀去除盐和SDS后上HPLC,丙酮除掉盐的时候难道盐不会也析出来? 按照经验,当样品中盐离子很高的时候,在用有机溶剂沉淀蛋白的时候,盐离子也是可以被沉淀下来的。反相柱子可以脱盐,但是多了对机器不好。    另外丙酮沉淀后,很多蛋白性质会很怪的,我想一般这一步不应该放在这么靠后。



电洗脱这个步骤也太靠前了,感觉,


感觉应该是你的样品含有某种东西,但是说不好是什么?
7楼2010-08-13 14:14:57
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sqhnsd

金虫 (正式写手)

2楼2010-08-09 09:49:37
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sqhnsd

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 致死之眠 at 2010-08-09 10:32:34:
检测波长

214 nm
4楼2010-08-09 13:59:58
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致死之眠

金虫 (知名作家)

梦幻初音

sqhnsd(金币+1): 2010-08-09 14:58:45
214nm干扰太大了,基线不稳是肯定的,飘的没法看
Iamendlishdi,Myenglishisveryhaoveryqiangda
5楼2010-08-09 14:05:47
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