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yrtsimehc

木虫 (正式写手)

[交流] 【讨论】关于分子对接时的力场选择 已有6人参与

各位高手,本人刚刚开始辅助药物设计。
    在最近的分子对接过程中,发现要对受体蛋白加一个立场。对于此方面不太了解。想请教各位力场选择有什么原则么?
    此外,也想请大家讨论一下,蛋白质加入不同的力场对于计算结果会有什么影响。
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tingjun

木虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-08-24 13:05:56
不同的对接软件用的立场是不一样的,蛋白一般用Charmm力场吧
7楼2010-08-24 09:39:22
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-08-07 10:59:29
在月球表面、在水里和在地面空气中,分别打你一拳,打拳的用同样的力量,被打的感觉一样吗?
2楼2010-08-07 10:14:09
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yrtsimehc

木虫 (正式写手)

太形象了!
   但是,高手能再具体说说在什么情况下用什么样的力场么?这个有没有什么经验?
  还有在作分子对接之前是不是必须“除水,加氢以及加力场”?
   多谢啦啊!
3楼2010-08-07 11:29:16
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by yalefield at 2010-08-07 10:14:09:
在月球表面、在水里和在地面空气中,分别打你一拳,打拳的用同样的力量,被打的感觉一样吗?

同样是打在身上,痛在心里。
除了你的亲人,没有人应该对你好,对你好的人,一定要珍惜。
4楼2010-08-08 08:25:30
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