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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【讨论】关于分子对接时的力场选择
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yrtsimehc

木虫 (正式写手)

[交流] 【讨论】关于分子对接时的力场选择 已有6人参与

各位高手，本人刚刚开始辅助药物设计。
    在最近的分子对接过程中，发现要对受体蛋白加一个立场。对于此方面不太了解。想请教各位力场选择有什么原则么？
    此外，也想请大家讨论一下，蛋白质加入不同的力场对于计算结果会有什么影响。
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1楼 2010-08-07 10:07:30
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tingjun

木虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-08-24 13:05:56
不同的对接软件用的立场是不一样的，蛋白一般用Charmm力场吧
赞一下(2人) 回复此楼
7楼2010-08-24 09:39:22
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-08-07 10:59:29
在月球表面、在水里和在地面空气中，分别打你一拳，打拳的用同样的力量，被打的感觉一样吗？
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2楼2010-08-07 10:14:09
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yrtsimehc

木虫 (正式写手)
太形象了！
   但是，高手能再具体说说在什么情况下用什么样的力场么？这个有没有什么经验？
  还有在作分子对接之前是不是必须“除水，加氢以及加力场”？
   多谢啦啊！
赞一下 回复此楼
3楼2010-08-07 11:29:16
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by yalefield at 2010-08-07 10:14:09:
在月球表面、在水里和在地面空气中，分别打你一拳，打拳的用同样的力量，被打的感觉一样吗？

同样是打在身上，痛在心里。
赞一下(1人) 回复此楼
除了你的亲人，没有人应该对你好，对你好的人，一定要珍惜。
4楼2010-08-08 08:25:30
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