24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 3438  |  回复: 8

yrtsimehc

超级版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

[交流] 【讨论】关于分子对接时的力场选择 已有6人参与

各位高手,本人刚刚开始辅助药物设计。
    在最近的分子对接过程中,发现要对受体蛋白加一个立场。对于此方面不太了解。想请教各位力场选择有什么原则么?
    此外,也想请大家讨论一下,蛋白质加入不同的力场对于计算结果会有什么影响。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子对接问题锦集 蛋白模拟与改造

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yalefield

超级版主

老汉一枚

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-08-07 10:59:29
在月球表面、在水里和在地面空气中,分别打你一拳,打拳的用同样的力量,被打的感觉一样吗?
2楼2010-08-07 10:14:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yrtsimehc

主管区长

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

太形象了!
   但是,高手能再具体说说在什么情况下用什么样的力场么?这个有没有什么经验?
  还有在作分子对接之前是不是必须“除水,加氢以及加力场”?
   多谢啦啊!
3楼2010-08-07 11:29:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tjegg

专家顾问

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by yalefield at 2010-08-07 10:14:09:
在月球表面、在水里和在地面空气中,分别打你一拳,打拳的用同样的力量,被打的感觉一样吗?

同样是打在身上,痛在心里。
除了你的亲人,没有人应该对你好,对你好的人,一定要珍惜。
4楼2010-08-08 08:25:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yrtsimehc

专家顾问

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

楼上回答不要过于隐晦,能具体点解决一下我的问题么?
5楼2010-08-08 08:47:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

CADD

专家顾问

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-08-22 21:10:31
主要看你用的是什么软件,比如sybyl,DS都需要加不同的立场,而MVD则不需加立场。还是先选择好对接软件再说吧。楼主可以找几篇关于对接的文献看一下,就有所了解了。
6楼2010-08-22 17:57:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tingjun

兑换贵宾

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-08-24 13:05:56
不同的对接软件用的立场是不一样的,蛋白一般用Charmm力场吧
7楼2010-08-24 09:39:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chongchong11

主管区长

Senior Engineer

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-08-24 21:14:19
大分子和小分子对接的话一般用的是Charmm力场,而且这个好像所得结果相对非常的准确!你也可以查看相关的文献。
Nature+Science=Wisdom
8楼2010-08-24 17:56:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chemozhang

超级版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《分子对接问题锦集
故地如重游月圆更寂寞
9楼2011-09-05 20:16:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yrtsimehc 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 环境工程 085701,267求调剂 +14 minht 2026-03-29 14/700 2026-04-01 01:42 by 1018329917
[考研] 311求调剂 +8 李芷新1 2026-03-31 8/400 2026-04-01 01:39 by 1018329917
[考研] 调剂推荐 +7 清酒714 2026-03-26 8/400 2026-03-31 22:12 by 544594351
[考研] 考研生物与医药调剂 +6 铁憨憨123425 2026-03-31 6/300 2026-03-31 17:48 by 544594351
[考研] 307分求调剂 +6 (o~o) 2026-03-31 6/300 2026-03-31 17:22 by 唐沐儿
[考研] 材料专硕调剂 +13 椰椰。 2026-03-29 13/650 2026-03-31 16:37 by hypershenger
[考研] 311求调剂 +9 蓝月亮亮 2026-03-30 9/450 2026-03-31 16:32 by yedezhan
[考研] 材料科学与工程调剂 +13 深V宿舍吧 2026-03-30 14/700 2026-03-31 16:28 by hypershenger
[考研] 362求调剂 +9 西南交材料专硕3 2026-03-31 9/450 2026-03-31 16:25 by w虫虫123
[考研] 353求调剂 +3 江上枫_26 2026-03-28 3/150 2026-03-31 15:53 by jp9609
[考研] 土木304求调剂 +4 兔突突突, 2026-03-31 5/250 2026-03-31 11:29 by 北风之神.
[考研] 266求调剂 +3 哇呼哼呼哼 2026-03-29 3/150 2026-03-31 10:06 by cal0306
[考研] 一志愿中海洋320化学工程与技术学硕求调剂 +8 披星河 2026-03-30 8/400 2026-03-31 08:53 by lbsjt
[考研] 生物学学硕,一志愿湖南大学,初试成绩338 +7 YYYYYNNNNN 2026-03-26 9/450 2026-03-30 20:29 by YYYYYNNNNN
[考研] 297求调剂 +17 田洪有 2026-03-26 18/900 2026-03-30 18:32 by nothing投稿中
[考研] 求调剂,一志愿 南京航空航天大学大学 ,080500材料科学与工程学硕 +6 @taotao 2026-03-26 7/350 2026-03-30 10:43 by 我是小康
[考研] 290求调剂 +3 dfffsar 2026-03-29 3/150 2026-03-29 22:38 by 毛毛毛阿莫2
[考研] 085600,专业课化工原理,321分求调剂 +5 大馋小子 2026-03-28 5/250 2026-03-29 08:56 by qingfeng258
[考研] 352分 化工与材料 +5 海纳百川Ly 2026-03-27 5/250 2026-03-28 03:39 by fmesaito
[考研] 0703化学338求调剂! +6 Zuhui0306 2026-03-26 7/350 2026-03-27 10:35 by shangxh
信息提示
请填处理意见