应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【讨论】关于分子对接时的力场选择
91/1返回列表
查看: 3702  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

yrtsimehc

木虫 (正式写手)

[交流] 【讨论】关于分子对接时的力场选择 已有6人参与

各位高手，本人刚刚开始辅助药物设计。
    在最近的分子对接过程中，发现要对受体蛋白加一个立场。对于此方面不太了解。想请教各位力场选择有什么原则么？
    此外，也想请大家讨论一下，蛋白质加入不同的力场对于计算结果会有什么影响。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子对接问题锦集 蛋白模拟与改造

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-08-07 10:07:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-08-07 10:59:29
在月球表面、在水里和在地面空气中，分别打你一拳，打拳的用同样的力量，被打的感觉一样吗？
赞一下(3人) 回复此楼
2楼2010-08-07 10:14:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yrtsimehc

木虫 (正式写手)
太形象了！
   但是，高手能再具体说说在什么情况下用什么样的力场么？这个有没有什么经验？
  还有在作分子对接之前是不是必须“除水，加氢以及加力场”？
   多谢啦啊！
赞一下 回复此楼
3楼2010-08-07 11:29:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by yalefield at 2010-08-07 10:14:09:
在月球表面、在水里和在地面空气中，分别打你一拳，打拳的用同样的力量，被打的感觉一样吗？

同样是打在身上，痛在心里。
赞一下(1人) 回复此楼
除了你的亲人，没有人应该对你好，对你好的人，一定要珍惜。
4楼2010-08-08 08:25:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yrtsimehc

木虫 (正式写手)
楼上回答不要过于隐晦，能具体点解决一下我的问题么？
赞一下 回复此楼
5楼2010-08-08 08:47:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

CADD

银虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-08-22 21:10:31
主要看你用的是什么软件，比如sybyl,DS都需要加不同的立场，而MVD则不需加立场。还是先选择好对接软件再说吧。楼主可以找几篇关于对接的文献看一下，就有所了解了。
赞一下(2人) 回复此楼
6楼2010-08-22 17:57:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tingjun

木虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-08-24 13:05:56
不同的对接软件用的立场是不一样的，蛋白一般用Charmm力场吧
赞一下(2人) 回复此楼
7楼2010-08-24 09:39:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chongchong11

至尊木虫 (著名写手)

Senior Engineer
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-08-24 21:14:19
大分子和小分子对接的话一般用的是Charmm力场，而且这个好像所得结果相对非常的准确！你也可以查看相关的文献。
赞一下(2人) 回复此楼
Nature+Science=Wisdom
8楼2010-08-24 17:56:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chemozhang

木虫 (正式写手)
帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《分子对接问题锦集》
赞一下 回复此楼
故地如重游月圆更寂寞
9楼2011-09-05 20:16:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yrtsimehc 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +21 羊腰板 2026-08-21 24/1200 2026-08-26 07:20 by finnigan
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 7K1CJE38xLG4 2026-08-25 5/250 2026-08-26 07:17 by cNXvBfCpiZOM
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 Qj98d49dHFb9 2026-08-25 5/250 2026-08-26 04:57 by cNXvBfCpiZOM
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候，我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 某些机构，以效率低为荣，以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 22/1100 2026-08-25 15:36 by 医学老男孩
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +25 yaoyewhu2008 2026-08-20 27/1350 2026-08-25 08:01 by Equinoxhua
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +14 ziyangfang 2026-08-19 17/850 2026-08-24 18:37 by 哈哈蛤？
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办？ +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 今天放榜吗？ +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 时间戳今天，20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭