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zhangying09

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】求助vasp 分子动力学 已有2人参与

我想求助vasp做第一性原理分子动力学的脚本文件,因为我想用他做硅纳米线的拉伸和压缩,因此我想大家如果有分子动力学的脚本文件请发我的邮箱
zhangying6971@126.com那样的话我对着mannual 学可能更容易上手一些,我学软件的时间不多了,因此希望各位一起学的能帮助一下,不胜感激。。。。
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beyondstar

木虫 (正式写手)

你说的太泛泛了,况且每人的算的体系都不同
2楼2010-08-02 17:44:07
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hedaors

禁虫 (正式写手)

隐清堂主

★ ★ ★ ★ ★ ★
qasd(金币+3):谢谢 2010-08-03 07:24:47
aylayl08(金币+3):谢谢解答 2010-08-03 14:18:26
这是一个例子,也许对你有提示作用

#------INCAR------

IBRION = 0 # 分子动力学
ISTART = 0 # from scratch
IALGO = 48 # 如果发现自恰不收敛的情况可换成 38。
NSW = 5000 # 时间步长,一般在 500 步左右就能达到平衡,但要想充分的话,最好 3000 以上。
NBLOCK = 1; KBLOCK = 50 # 每个 NBLOCK 步数后,对关联函数和 DOS 会被计算,然后离子位置信息写
到相应的 XDATCAR。在 KBLOCK*NBLOCK 步数后,对关联函数和 DOS 会被写到 PCDAT 和 DOSCAR。
ISYM = 0 # 取消对称性。
SMASS = -3 # -3 NVE ensemble, -1 模拟退火. >0 NVT ensemble
POTIM = 2.0 # 时间步长。一般 1 到 3. 这个最好跑一下 NVE 系综,看一下总能是否守恒。
ISMEAR = -1; SIGMA = 0.1 # -1 是电子费米达拉克占据,主要用来处理电子含温。
LREAL = A
ISIF = 2 # 就算压力。
NPACO = 200,APACO = 10 # 计算对关联分布的。具体可以看 manual,很简单。
NELMIN = 6 # 电子最少的自恰步数,一般是 4 到 8。
NBANDS = 700 # 能带数,这个最好自己设,否则容易出问题。
LCHARG = F # 尽量不写 CHG,太占硬盘资源。
TEBEG = 1000;TEEND=1000 # 初始温度和末态温度,默认是两者相当,所以一般设 TEBEG 就可以。

##------END---------

PREC 一般也不用设,默认即可。ENCUT 会等于 ENMAX。我能想起来的参数就这些,有问题可以直接问
我。因为分子动力学是一个统计概念,当然原子越多越好的。所以我认为最少也得算 100 个原子。一般 100 个
原子的话,k 点用一个就可以。注意的是在分子动力学里,PSTRESS 是没有的用的。因为没有 NPH 或 NPT
系综。再有分子动力学常用的几个概念就是,对关联函数,这个实验可测。写在 PCDAT 里。速度自关联函数,
这个可以自己看一下公式,很简单,可以自己写程序做。
做分子动力学最好用 vasp5,因为很多参数都不用测了,4.6 好像还得测,
否则慢。还有实际 vasp 在输出温度是需要修正的,这个可以看看 manual,很简单,如果原子数多的话可以不
修正。还有压力也需要修正,但通常影响不大,可以直接用 vasp 的。
3楼2010-08-02 22:46:18
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