| 查看: 6389 | 回复: 18 | ||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||||
[交流]
【原创】MS的过渡态搜索方法不合理！ 已有12人参与
|
||||
|
MS的的DMol和CASTEP模块中提供的LST/QST搜索过渡态的方法不合理！ 其利用RMS的收敛标准不能保证每个原子上的力都收敛，也就是无法满足鞍点的要求。 因此用LST/QST方法找过渡态一定要小心，通常得到的能垒是高估的。 在DMol中最好用Eigenvector following找过渡态！！！ 欢迎讨论！ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 MS第一性原理 |
» 猜你喜欢
售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急
已经有4人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有5人回复
-
售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急
已经有5人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急
已经有5人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急
已经有5人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有5人回复
-
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 帮忙说说怎样容易找过渡态？
已经有8人回复
- 利用MS里的Dmol模块搜索过渡态不收敛
已经有5人回复
- 【求助】MS进行过渡态搜索失败，请教原因
已经有7人回复
- 【求助】MS中有关于优化，计算过渡态的各个参数设定方式以及意思是什么啊？请高手指点
已经有28人回复
- 【求助】ms中也搜寻过渡态，那ms能用来搜寻有机小分子催化的过渡态吗？
已经有5人回复
- 【求助】ms中也搜寻过渡态，那ms能用来搜寻有机小分子催化的过渡态吗？
已经有3人回复
- 【求助】用MS算扩散
已经有17人回复
cherrily
木虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 6352.3
- 散金: 80
- 帖子: 417
- 在线: 203.4小时
- 虫号: 416393
- 注册: 2007-06-30
- 性别: MM
- 专业: 无机纳米化学
5楼2010-07-08 10:13:14
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lvjian8596(金币+3):感谢交流！ 2010-07-07 22:25:48
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lvjian8596(金币+3):感谢交流！ 2010-07-07 22:25:48
|
DMol中找过渡态要 先用TS Search - searches for a transition state using linear synchronous transit (LST) and quadratic synchronous transit (QST) methods 再进行 TS Optimization - searches for a transition state using eigenvector-following methods 最后再 TS Confirmation - produces a refined reaction path based on an LST or QST search |
2楼2010-07-07 22:09:22
cmwangdft
木虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1870.5
- 散金: 65
- 红花: 2
- 帖子: 111
- 在线: 224小时
- 虫号: 487968
- 注册: 2007-12-29
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
3楼2010-07-07 23:10:55
akashia
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 318.5
- 散金: 37
- 帖子: 57
- 在线: 8.9小时
- 虫号: 733830
- 注册: 2009-03-28
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
|
请问您说的 TS Optimization - searches for a transition state using eigenvector-following methods 具体是怎么操作的啊？我先是TS Search（同时计算频率）找到了一个过渡态，然后该怎么操作呢？ 提示：In order to perform a TS Optimization caculation, a Hessian matrix must be present in the model.A Hessian matrix can be generated by running a frequency calculation on the model.Alternatively, a valid Hessian matrix can be imported.Once a Hessian is present, a normal mode should then be selected. 其中所提到的model是指哪个呢？ |
4楼2010-07-08 09:55:38
