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xiaoboy185

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】dmol跑动力学 已有5人参与

用dmol跑动力学,设定在1000k下跑5000步,但是跑了不到500步就出错了:


Error: Instability in the thermostat.
Please restart the simulation with current geometry.
This will reset the thermostat.


这个时候,最后的构型和初始的还没有啥太大的差异,那么是不是应该在最后这个
构型的基础上继续跑完那剩下的4500步呢?

还是说这就表明这个结构不稳定?
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xiaoboy185

金虫 (正式写手)

那就必须顶起来了
3楼2010-07-01 12:06:06
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akashia

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我也遇到了和你相同的问题,提示也是这样,NVT模拟,希望有知道的朋友能告知一下是何原因,又该怎么处理,不胜感激。
悄然回首,已不知春秋。
2楼2010-07-01 10:43:04
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youzhizhe

荣誉版主 (职业作家)

有志者

优秀版主优秀版主

同问 希望有人认真回答
微博http://weibo.com/10986069
4楼2010-07-01 14:21:12
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xiaoboy185

金虫 (正式写手)

★ ★
lvjian8596(金币+2):感谢交流!自己解决了,希望和大家分享经验! 2010-07-01 21:28:39
我感觉是热浴的影响,我之前是默认的热浴,好像是mass....
现在改成了N-T chain的热浴,一直跑了1000步了   暂时没出错
待续......
5楼2010-07-01 21:19:22
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