24小时热门版块排行榜    

查看: 3542  |  回复: 8
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

dragon5061

至尊木虫 (正式写手)

学生

[交流] 【求助】高斯计算中如何冻结一部分原子 已有4人参与

哪位大侠知道在高斯计算中如何冻结一部分原子,看文献时看到“the SiH3 group at each terminal of the cluster model was frozen to retain the constraint originated from the 3D crystal lattices”,敬请各位指导一下,不胜感激!

Thank you very much!
回复此楼
相信自己,努力拼搏!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

875418128

金虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主能把the SiH3 group at each terminal of the cluster model was frozen to retain the constraint originated from the 3D crystal lattices这句话对应的文献发给我或者相应的链接发给我吗?小虫在做优化的时候也用了类似的方法但是希望能找到文献支持,非常感谢!
9楼2015-09-13 14:38:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

2008从容

金虫 (小有名气)


heyo_123(金币+1):鼓励应助!! 2010-06-24 08:44:44
dragon5061(金币+5):多谢你的帮助,不胜感激! 2010-06-24 09:26:39
方法1:
用Gaussview打开gjf文件,gaussView/edit/redundant coordinates
点击左上角的绿色加号,在下面的选项中coordinates中选择cartesian coordinate,下面的选项中选择freeze coordinate。然后在结构图中选择要冻结的原子,然后保存就可以了。
方法2:
    直接在gjf文件的坐标后面加:X 原子标号 F,每个要冻结的原子占一行。
      例如要冻结第23、24号原子,则输入:
X  23  F
X  24  F
2楼2010-06-24 08:39:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sophia_999

金虫 (小有名气)

dragon5061(金币+2):谢谢! 2010-06-24 10:34:29
gaussview生成的xyz格式,一般如下:

Si  0   x1  y1  z1
H  0   x2  y2  z2
.....

对于想固定的原子把0改成-1就可以了。
3楼2010-06-24 09:46:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dragon5061

至尊木虫 (正式写手)

学生

引用回帖:
Originally posted by 2008从容 at 2010-06-24 08:39:04:
方法1:
用Gaussview打开gjf文件,gaussView/edit/redundant coordinates
点击左上角的绿色加号,在下面的选项中coordinates中选择cartesian coordinate,下面的选项中选择freeze coordinate。然后在结构图中选 ...

你好,按方法一说的总是报错如下


如何处理,谢谢指导。
相信自己,努力拼搏!
4楼2010-06-24 10:33:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见