应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】高斯计算中如何冻结一部分原子
51/1返回列表
查看: 3680  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

dragon5061

至尊木虫 (正式写手)

学生

[交流] 【求助】高斯计算中如何冻结一部分原子 已有4人参与

哪位大侠知道在高斯计算中如何冻结一部分原子，看文献时看到“the SiH3 group at each terminal of the cluster model was frozen to retain the constraint originated from the 3D crystal lattices”，敬请各位指导一下，不胜感激！

Thank you very much!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
相信自己，努力拼搏！
1楼 2010-06-23 23:00:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

2008从容

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by dragon5061 at 2010-06-24 10:33:48:

你好，按方法一说的总是报错如下


如何处理，谢谢指导。

把gjf文件中的坐标形式改为直角坐标
赞一下 回复此楼
7楼2010-06-24 11:40:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

2008从容

金虫 (小有名气)
★
heyo_123(金币+1):鼓励应助！！ 2010-06-24 08:44:44
dragon5061(金币+5):多谢你的帮助，不胜感激！ 2010-06-24 09:26:39
方法1：
用Gaussview打开gjf文件，gaussView/edit/redundant coordinates
点击左上角的绿色加号，在下面的选项中coordinates中选择cartesian coordinate，下面的选项中选择freeze coordinate。然后在结构图中选择要冻结的原子，然后保存就可以了。
方法2：
    直接在gjf文件的坐标后面加：X 原子标号 F，每个要冻结的原子占一行。
      例如要冻结第23、24号原子，则输入：
X  23  F
X  24  F
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2010-06-24 08:39:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sophia_999

金虫 (小有名气)
dragon5061(金币+2):谢谢！ 2010-06-24 10:34:29
gaussview生成的xyz格式，一般如下：

Si  0   x1  y1  z1
H  0   x2  y2  z2
.....

对于想固定的原子把0改成-1就可以了。
赞一下 回复此楼
3楼2010-06-24 09:46:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dragon5061

至尊木虫 (正式写手)

学生
引用回帖:
Originally posted by 2008从容 at 2010-06-24 08:39:04:
方法1：
用Gaussview打开gjf文件，gaussView/edit/redundant coordinates
点击左上角的绿色加号，在下面的选项中coordinates中选择cartesian coordinate，下面的选项中选择freeze coordinate。然后在结构图中选 ...

你好，按方法一说的总是报错如下


如何处理，谢谢指导。
赞一下 回复此楼
相信自己，努力拼搏！
4楼2010-06-24 10:33:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 293求调剂 +5 zjl的号 2026-03-16 6/300 2026-03-17 10:13 by zhyzzh
[考研] 271求调剂 +11 生如夏花… 2026-03-11 13/650 2026-03-17 09:02 by 雾散后相遇lc
[考研] 考研化学学硕调剂，一志愿985 +3 张vvvv 2026-03-15 5/250 2026-03-16 20:25 by 张vvvv
[考研] 0854控制工程 359求调剂 可跨专业 +3 626776879 2026-03-14 9/450 2026-03-16 17:42 by 626776879
[考研] 070300化学学硕求调剂 +6 太想进步了0608 2026-03-16 6/300 2026-03-16 16:13 by kykm678
[考研] 中科院材料273求调剂 +4 yzydy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 15:59 by Gaodh_82
[考研] 085600调剂 +5 漾漾123sun 2026-03-12 6/300 2026-03-16 15:58 by 漾漾123sun
[考研] 277材料科学与工程080500求调剂 +3 自由煎饼果子 2026-03-16 3/150 2026-03-16 14:10 by 运气yunqi
[考研] 招收0805（材料）调剂 +3 18595523086 2026-03-13 3/150 2026-03-14 00:33 by 123%、
[考研] 311求调剂 +5 牛乳糖的卡卡 2026-03-10 5/250 2026-03-14 00:05 by JourneyLucky
[考研] 0805，333求调剂 +3 112253525 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:42 by JourneyLucky
[考研] 285 求调剂 资源与环境 一志愿北京化工大学 +3 未名考生 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:04 by JourneyLucky
[考研] 0703化学调剂 +4 快乐的香蕉 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:41 by JourneyLucky
[考研] 0856材料与化工301求调剂 +5 奕束光 2026-03-13 5/250 2026-03-13 22:00 by 星空星月
[考研] 求调剂 +7 18880831720 2026-03-11 7/350 2026-03-13 16:10 by JourneyLucky
[考研] 307求调剂 +5 超级伊昂大王 2026-03-12 5/250 2026-03-13 15:56 by 棒棒球手
[考研] 求调剂 +3 程雨杭 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:06 by JourneyLucky
[考研] 289求调剂 +3 李政莹 2026-03-12 3/150 2026-03-13 11:02 by 求调剂zz
[考研] 321求调剂（食品/专硕） +3 xc321 2026-03-12 6/300 2026-03-13 08:45 by xc321
[考博] 读博申请 +5 感dd 2026-03-10 7/350 2026-03-11 17:02 by QGZDSYS
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭