应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】高斯计算中如何冻结一部分原子
51/1返回列表
查看: 3683  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

dragon5061

至尊木虫 (正式写手)

学生

[交流] 【求助】高斯计算中如何冻结一部分原子 已有4人参与

哪位大侠知道在高斯计算中如何冻结一部分原子，看文献时看到“the SiH3 group at each terminal of the cluster model was frozen to retain the constraint originated from the 3D crystal lattices”，敬请各位指导一下，不胜感激！

Thank you very much!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
相信自己，努力拼搏！
1楼 2010-06-23 23:00:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dragon5061

至尊木虫 (正式写手)

学生
引用回帖:
Originally posted by sophia_999 at 2010-06-24 09:46:51:
gaussview生成的xyz格式，一般如下：

Si  0   x1  y1  z1
H  0   x2  y2  z2
.....

对于想固定的原子把0改成-1就可以了。

弱弱的问一下，如何用将gaussview输出的gjf文件设置成xyz格式的。
赞一下 回复此楼
相信自己，努力拼搏！
5楼2010-06-24 10:35:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

2008从容

金虫 (小有名气)
★
heyo_123(金币+1):鼓励应助！！ 2010-06-24 08:44:44
dragon5061(金币+5):多谢你的帮助，不胜感激！ 2010-06-24 09:26:39
方法1：
用Gaussview打开gjf文件，gaussView/edit/redundant coordinates
点击左上角的绿色加号，在下面的选项中coordinates中选择cartesian coordinate，下面的选项中选择freeze coordinate。然后在结构图中选择要冻结的原子，然后保存就可以了。
方法2：
    直接在gjf文件的坐标后面加：X 原子标号 F，每个要冻结的原子占一行。
      例如要冻结第23、24号原子，则输入：
X  23  F
X  24  F
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2010-06-24 08:39:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sophia_999

金虫 (小有名气)
dragon5061(金币+2):谢谢！ 2010-06-24 10:34:29
gaussview生成的xyz格式，一般如下：

Si  0   x1  y1  z1
H  0   x2  y2  z2
.....

对于想固定的原子把0改成-1就可以了。
赞一下 回复此楼
3楼2010-06-24 09:46:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dragon5061

至尊木虫 (正式写手)

学生
引用回帖:
Originally posted by 2008从容 at 2010-06-24 08:39:04:
方法1：
用Gaussview打开gjf文件，gaussView/edit/redundant coordinates
点击左上角的绿色加号，在下面的选项中coordinates中选择cartesian coordinate，下面的选项中选择freeze coordinate。然后在结构图中选 ...

你好，按方法一说的总是报错如下


如何处理，谢谢指导。
赞一下 回复此楼
相信自己，努力拼搏！
4楼2010-06-24 10:33:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料专硕306英一数二 +5 z1z2z3879 2026-03-16 7/350 2026-03-17 11:07 by 学员h26Tkc
[考研] 302求调剂 +4 小贾同学123 2026-03-15 8/400 2026-03-17 10:33 by 小贾同学123
[考研] 考研调剂 +3 淇ya_~ 2026-03-17 5/250 2026-03-17 09:25 by Winj1e
[考研] 一志愿，福州大学材料专硕339分求调剂 +3 木子momo青争 2026-03-15 3/150 2026-03-17 07:52 by laoshidan
[考研] 材料与化工求调剂 +3 为学666 2026-03-16 3/150 2026-03-16 15:09 by 加号+
[考研] 312求调剂 +3 陌宸希 2026-03-16 4/200 2026-03-16 15:06 by peike
[考研] 0856求调剂 +3 刘梦微 2026-03-15 3/150 2026-03-16 10:00 by houyaoxu
[考研] 311求调剂 +6 冬十三 2026-03-15 6/300 2026-03-16 08:00 by wang_dand
[考研] 070305求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-14 4/200 2026-03-15 11:04 by peike
[考研] 中科大材料与化工319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:10 by ms629
[考研] 材料与化工 323 英一+数二+物化，一志愿：哈工大 本人本科双一流 +4 自由的_飞翔 2026-03-13 5/250 2026-03-14 19:39 by hmn_wj
[考研] 招收0805（材料）调剂 +3 18595523086 2026-03-13 3/150 2026-03-14 00:33 by 123%、
[考研] 311求调剂 +8 zchqwer 2026-03-10 8/400 2026-03-14 00:01 by JourneyLucky
[考研] 材料工程,326分，求调剂 +6 KRSLSR 2026-03-10 6/300 2026-03-13 23:47 by JourneyLucky
[考研] 0805，333求调剂 +3 112253525 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:42 by JourneyLucky
[考研] 341求调剂 +3 番茄头--- 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:07 by JourneyLucky
[考研] 【0856】化学工程（085602）313 分，本科学科评估A类院校化学工程与工艺，诚求调剂 +7 小刘快快上岸 2026-03-11 7/350 2026-03-13 16:06 by ruiyingmiao
[考研] 274求调剂 +3 S.H1 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:15 by JourneyLucky
[考研] 308求调剂 +3 是Lupa啊 2026-03-12 3/150 2026-03-13 14:30 by 求调剂zz
[考研] 290求调剂 +3 柯淮然 2026-03-10 8/400 2026-03-11 13:48 by 柯淮然
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭