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【求助/交流】16s进化树+细菌鉴定 达人 请进~~~ 已有5人参与
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小弟有两株细菌A和B，外表形态相似，但是还是有差别的，还有就是分离地点不一样。 16s全长测序后，发现仅有一个碱基差别，见图 测序图谱 A,7个C  B,8个C  NCBI比对，都是正确的，而且都是属于一个属  A  B  进化树划出来是这样的，  请问，这俩能算两种菌么？还有其他的方法区分么 谢谢指教~~~ [ Last edited by 未曾走过的路 on 2010-6-20 at 13:12 ] |
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zemin_fang
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3楼2010-06-20 14:54:02
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amisking(金币+2):good! 2010-06-20 15:55:11
未曾走过的路(金币+2):谢谢~~~ 2010-06-20 18:07:47
amisking(金币+2):good! 2010-06-20 15:55:11
未曾走过的路(金币+2):谢谢~~~ 2010-06-20 18:07:47
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判断菌株A和B 是否是同一株菌株，你可以先比对16S rRNA基因序列的相识性，如果其相似性高于97%，就有必要作菌株之间的DNA-DNA 杂交试验来确定着2株菌株是否为同一柱菌株。 依据楼主所言，你的菌株A和B 的16S rRNA基因序列的相识性应该是高于97%之一标准了，所以必须做DNA-DNA 杂交试验来确定是否为同一株菌株。（杂交值如高于70%则是同一株菌株，如低于70%则是不同的菌株）。 另外建议楼主可以参考IJSEM上的文章。 |
4楼2010-06-20 15:51:10
leonn
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5楼2010-06-20 16:52:01
6楼2010-06-20 18:10:57
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