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lfgc8505

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】PFU扩不出东西来,请各路大侠帮帮小虫啊~~~~~~~ 已有11人参与

最近在做PCR,因为要扩的片段比较长,1800BP.用专扩长片段的LA酶扩了,效果可以,但是测序发现有突变,因为我要求不能有突变,所以没用。改用promega的PFU后,怎么都扩不出东西来,退火温度都试了(50-65),之前用的是57度都能扩出来。
我的反应程序,是95 3分钟
                95 30秒
                50/65 30秒
                72 4分钟 30个循环
                72 10分钟
               反应体系使用的是说明书上的推荐体系。

但是就是没有我的目的条带,只有两条约800和300的杂带!

崩溃了,这马上又要回报了,还是做出来啊~请各路虫友帮帮忙啊。发表一下你们的高建啊!
小虫不胜感激!
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zemin_fang

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+1):感谢交流~~ 2010-06-17 10:49:33
LA保真性很差。
你的模板是不是降解了?如果没有,你可以换他人可以保证扩增出来的DNA做模板,进行扩增来确定你的试剂是否出问题。
2楼2010-06-17 10:22:03
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陈思容

铜虫 (正式写手)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
这个最好附图看看,我也在用PFU做,很崩溃
3楼2010-06-17 10:45:45
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月月大可

木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
1949stone(金币+1):谢谢交流 2010-06-17 11:59:17
加大引物浓度!!!!
4楼2010-06-17 10:46:59
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jasco

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
1949stone(金币+1):谢谢交流 2010-06-17 11:59:26
touchdown试试看,还有就是延伸时间2min足矣
5楼2010-06-17 11:01:20
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guangmingzhizi

铁虫 (初入文坛)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
1949stone(金币+1):谢谢交流 2010-06-17 11:59:34
lmzxcom1(金币+1):能不能给新人解释多一些呢,期待 2010-06-17 16:20:40
PFU会降解你的引物的,从这方面入手来解决下吧。
我的blog:http://vipbio.bokee.com
6楼2010-06-17 11:25:25
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dianaofyezi

金虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
1949stone(金币+1):谢谢交流 2010-06-17 11:59:42
PFU对体系内要求比较苛刻。既然LA能够扩增出来,说明还是反应体系的问题。一般PFU能够提供特别的buffer,你可以试试。
52187644
7楼2010-06-17 11:32:44
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可可猫

铜虫 (小有名气)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
没有用过这个诶
我用的是prime star  效果还可以
但是是片段很小
8楼2010-06-17 16:07:43
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zsxnd

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by jasco at 2010-06-17 11:01:20:
touchdown试试看,还有就是延伸时间2min足矣

这是高人!@
9楼2010-06-17 16:24:59
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空谷幽风

金虫 (正式写手)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
1800的片段不算大,用KOD或PBO的话1:30足够了,另外看一下突变多吗,如果只有一两个地方的话可以做一下修复,我们公司3000bp的片段都是经常扩的,效果都不错
a?,c??ae~?a,EURc§?c?μé-,cs,,a‘?é?“i1/4?i1/4?i1/4?i1/4?
10楼2010-06-17 18:26:42
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