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【求助】对称分子如何完美构建已有6人参与
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请教各位高手： 1.这个分子是Cs对称还是C2对称？ 2.我用chemdraw画好后，在gv中不能很好地显示其对称性（very loose也没用），尤其是苯环上取代基复杂的时候。能否有比较简便的软件或技巧来构建？ 3.目前根据某种点群对称来构建分子式的软件有哪些？ 我可能钻牛角尖了，想构建出一个对称的初始结构。谢谢！ |
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c2构型，拿着玩去吧，小弟弟要乖哈！ ==gjf文件开始== # pm3 S 0 1 C -0.57381885 0.53911553 -1.87064557 C 0.57381885 -0.53911553 -1.87064557 C 0.32212800 -1.18965242 -0.55471539 C -0.32212800 1.18965242 -0.55471539 H -0.57488486 1.23246089 -2.68561249 H -1.50742280 0.01643040 -1.87980666 H 1.50742280 -0.01643040 -1.87980666 H 0.57488486 -1.23246089 -2.68561249 H -0.54329592 -1.81210834 -0.64685700 H 0.54329592 1.81210834 -0.64685700 C 0.00000000 0.00000000 0.38488007 O 0.00000000 0.00000000 1.64300316 C -1.49895136 2.06566861 -0.01094938 H -1.26668429 2.46891962 0.95255497 H -1.67334679 2.86564398 -0.69980760 C 1.49895136 -2.06566861 -0.01094938 H 1.26668429 -2.46891962 0.95255497 H 1.67334679 -2.86564398 -0.69980760 C 2.76125269 -1.19602354 0.05757277 C 3.15145378 -0.73708184 1.31597933 C 3.51455633 -0.86681534 -1.06923854 C 4.29433759 0.05144632 1.44736307 H 2.55691954 -0.99615806 2.20403920 C 4.65836572 -0.07887566 -0.93785733 H 3.20726009 -1.22859653 -2.06111172 C 5.04826939 0.38038621 0.32015327 H 4.60161036 0.41374794 2.43913798 H 5.25234594 0.18018916 -1.82642199 C -2.76125269 1.19602354 0.05757277 C -3.51455633 0.86681534 -1.06923854 C -3.15145378 0.73708184 1.31597933 C -4.65836572 0.07887566 -0.93785733 H -3.20726009 1.22859653 -2.06111172 C -4.29433759 -0.05144632 1.44736307 H -2.55691954 0.99615806 2.20403920 C -5.04826939 -0.38038621 0.32015327 H -5.25234594 -0.18018916 -1.82642199 H -4.60161036 -0.41374794 2.43913798 C 6.31020109 1.25100643 0.46557958 H 7.16998918 0.62055014 0.55607435 H 6.41457023 1.87478478 -0.39750075 H 6.22284018 1.86259559 1.33920809 C -6.31020109 -1.25100643 0.46557958 H -7.16998918 -0.62055014 0.55607435 H -6.41457023 -1.87478478 -0.39750075 H -6.22284018 -1.86259559 1.33920809 ==gjf文件结束== |
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 呵呵，hairan老师，不是小卒要拆您的台，而是如下：我思考了下，如果五元环如果是平的，那么确实能搭出C2v结构的，这种结构是五元环、两个六元环、两个正四面体型的C、两端的C、羰基氧全部在一个平面上，这样，C2V也就得到了。However，这种C2v结构必然是要精心调整那两个“把苯环和五元环连接起来”的四面体型碳的连接情况。后果是：您通过这种“强硬的”方式，得到了C2V，那么在opt过程中，由于对称性的限制，几乎必然的要得到虚频……  如果我来算，我宁可设定为C2，以免造成对称性限制的虚频。即使我画的是C2V，那么我也会加上symm(pg=c2)关键字。呵呵hairan老师您说呢？  又及：跟你们这些前辈唱反调，小卒我总是特别惴惴不安…… [ Last edited by yjcmwgk on 2010-6-10 at 21:46 ] |
8楼2010-06-10 21:37:25
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……拜拜的涅！10楼2010-06-10 21:49:14