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penta8165

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】对称分子如何完美构建 已有6人参与

请教各位高手:

1.这个分子是Cs对称还是C2对称?
2.我用chemdraw画好后,在gv中不能很好地显示其对称性(very loose也没用),尤其是苯环上取代基复杂的时候。能否有比较简便的软件或技巧来构建?
3.目前根据某种点群对称来构建分子式的软件有哪些?

我可能钻牛角尖了,想构建出一个对称的初始结构。谢谢!
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
heyo_123:鼓励交流!! 2010-06-12 10:54:21
引用回帖:
Originally posted by bay__gulf at 2010-06-10 21:47:33:
Cs和C2应该都存在, C2v有点悬
因为都只是sigma键在旋转, 能量相差不大, 室温下两种都有一定几率
大的分子对称性不好调, 可以先从五元环开始, 逐步加外侧的基团
边加边调对称性

cs是不可能滴。按照楼主给的分子结构,中心的那个五元环呢不可能有对称面滴。

楼主给出的分子结构中,中间的那个五元环不可能是平面滴

不小心又拆了bay的台哩……偶去面壁思过哩…………拜拜的涅!

[ Last edited by yjcmwgk on 2010-6-10 at 21:51 ]
10楼2010-06-10 21:49:14
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zhangfq7112

银虫 (正式写手)

用MaterialStudio,很容易!

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
erylingjet(金币+1):感谢交流 2010-06-10 16:46:41
用MaterialStudio,很容易!
2楼2010-06-10 10:39:43
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
erylingjet(金币+2):感谢交流 2010-06-10 16:46:49
手动在Gv中画吧,chemdraw产生的结构很白痴的
如果中间的那个五元环下面是个双键,结构是c2v,如果是单键,结构是c2
据权威报纸调查,84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历,故应该禁止经营电子游戏。据我们所知,100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历,故制鞋厂应该停业。
3楼2010-06-10 14:59:04
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
c2构型,拿着玩去吧,小弟弟要乖哈!
==gjf文件开始==
# pm3

S

0 1
C                 -0.57381885    0.53911553   -1.87064557
C                  0.57381885   -0.53911553   -1.87064557
C                  0.32212800   -1.18965242   -0.55471539
C                 -0.32212800    1.18965242   -0.55471539
H                 -0.57488486    1.23246089   -2.68561249
H                 -1.50742280    0.01643040   -1.87980666
H                  1.50742280   -0.01643040   -1.87980666
H                  0.57488486   -1.23246089   -2.68561249
H                 -0.54329592   -1.81210834   -0.64685700
H                  0.54329592    1.81210834   -0.64685700
C                  0.00000000    0.00000000    0.38488007
O                  0.00000000    0.00000000    1.64300316
C                 -1.49895136    2.06566861   -0.01094938
H                 -1.26668429    2.46891962    0.95255497
H                 -1.67334679    2.86564398   -0.69980760
C                  1.49895136   -2.06566861   -0.01094938
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C                  3.15145378   -0.73708184    1.31597933
C                  3.51455633   -0.86681534   -1.06923854
C                  4.29433759    0.05144632    1.44736307
H                  2.55691954   -0.99615806    2.20403920
C                  4.65836572   -0.07887566   -0.93785733
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C                  6.31020109    1.25100643    0.46557958
H                  7.16998918    0.62055014    0.55607435
H                  6.41457023    1.87478478   -0.39750075
H                  6.22284018    1.86259559    1.33920809
C                 -6.31020109   -1.25100643    0.46557958
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==gjf文件结束==
4楼2010-06-10 19:31:39
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