| 查看: 5407 | 回复: 22 | |||||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||||||
[交流]
【求助】build layer合并两个界面时的小问题 已有4人参与
|
|||||||
|
我想算两种物质之间的结合能，就是把切割后的两个面拼接到一起。目前问题如下： 1。cleave后，我看help中说要进行Re-orient，方向改来改去也没看出个所以然，好像没什么区别，这步到底有什么作用，谢谢？ 2。关键问题是：用build layer合并切割面时，如何让这两个切割面相对，或者说是接触（即中间真空设为0时），我这老是下层切割面连着上层的周期结构，再上去才是上层的切割面，我的意思是想把上层反个头。这样才是中间接触，界面两边是两种物质的周期性结构，这才是我想要的结构。 3。按理说，cleave后的面应该几何优化后再去build layer，我想算两种物质之间的结合能是不是不用先优化面哦，直接用切后的面build layer？因为优化后都带着真空层，最后build layer后还要想法去掉真空层吧，此外我还发现优化后，原子之间会成健，rebuild后虽然键消失，但真空层外端却多出现数个原子，然后再用这时的结构去build layer，最后的结构也多出现些原子，是不是“rebuild后虽然键消失，但真空层外端却多出现数个原子，”这步就更没有必要哦？ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 第一性原理 | 待看的文章 | 第一性原理 | ms建立界面 |
» 猜你喜欢
调剂
已经有12人回复
-
求调剂 材料与工程 324分 专硕
已经有13人回复
-
化学工程与技术324调剂
已经有18人回复
-
材料085601调剂
已经有9人回复
-
一志愿西北工业大学289 085602
已经有13人回复
-
291 求调剂
已经有13人回复
-
生物与医药273求调剂
已经有19人回复
-
生物与医药调剂
已经有5人回复
-
08600生物与医药-327
已经有10人回复
-
085601初试330分找调剂
已经有10人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 弱弱的问一个很白痴的问题，减压蒸馏和常压蒸馏的区别
已经有34人回复
- 两个基因融合构建真核表达载体需要去掉信号肽吗?
已经有7人回复
- 问一个有趣的问题：是不是外导回复的邮件里有unfortunately的，一般最后都没戏了？
已经有10人回复
- 求助柱层析问题，急
已经有8人回复
- 请教关于PAUP软件的界面问题，谢谢了！
已经有6人回复
- （紧急）邮件发送电子材料出现问题
已经有11人回复
- 合成全乙酰基甘露糖和半乳糖时出现的问题
已经有6人回复
- 请高手帮忙，热加工图绘制,并把两图合并起来。
已经有12人回复
- 【求助】组合数学中的两个队列合并问题
已经有4人回复
- 在Endnote里，怎么将两个library里文件合并在一个里？
已经有8人回复
- 求助关于origin8 六个图层合并问题
已经有8人回复
Zpffpz
铁杆木虫 (职业作家)
金属小光头
- 1ST强帖: 1
- 应助: 70 (初中生)
- 贵宾: 0.662
- 金币: 6101.8
- 散金: 3380
- 红花: 34
- 沙发: 5
- 帖子: 3560
- 在线: 742.8小时
- 虫号: 1119891
- 注册: 2010-10-11
- 性别: GG
- 专业: 金属材料表面科学与工程
8楼2012-04-22 20:52:06
acridine
木虫 (正式写手)
- 1ST强帖: 11
- 应助: 13 (小学生)
- 金币: 4901.6
- 红花: 13
- 帖子: 706
- 在线: 389.5小时
- 虫号: 305478
- 注册: 2006-12-10
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
★ ★ ★ ★ ★
8240668(金币+2):谢谢参与
zzy870720z(金币+3):谢谢指导，期待您更好的表现 2010-06-08 21:27:18
xiaohunhun(金币+1):xiexie 2010-06-08 23:32:09
8240668(金币+20):太谢谢你的回复了！之前是不怎么会贴图，我马上上图，强烈期待着你再来指导！ 2010-06-09 16:36:51
8240668(金币+2):谢谢参与
zzy870720z(金币+3):谢谢指导，期待您更好的表现 2010-06-08 21:27:18
xiaohunhun(金币+1):xiexie 2010-06-08 23:32:09
8240668(金币+20):太谢谢你的回复了！之前是不怎么会贴图，我马上上图，强烈期待着你再来指导！ 2010-06-09 16:36:51
|
这位兄弟还是截几个图吧，这种问题仅仅靠语言描述太难以说清楚了。 1。关于Re-orient，我知道建立表面或其他超胞的时候有个选项是用来设置晶体坐标系a、b、c和空间坐标系x、y、z的关系，诸如另c与z方向一致之类的。不知道楼主说的是否是这个地方的设置，这并不影响你的计算。如果不是这个设置，那最好贴个图出来。 2。这个问题没太看懂，尤其是“下层切割面连接着上面的周期结构”，最好贴个图。不过提醒你的是最后建立的模型中肯定是两个界面的，即整个模型实际上描述的是两个slab层交替出现的周期排列(|AB|=...ABABABABAB...，而仔细想一下你会发现，你的超胞|AB|中是有两个界面的)，不可能出现你说的一个界面，两侧是纯周期结构的情况。 3。如果你建立的是界面模型，那么没有必要优化表面，除非你强调的是“发生表面重构之后，才进一步形成的界面”。 另外后面说的“真空层外端却多出现数个原子”，这个实在难以抽象出来是什么样子的，最好截图。 “两种物质之间的结合能”，这个说法比较怪异，最好确定一下，你是不是想分析界面能，或界面形成能之类的。 |
2楼2010-06-08 20:31:46
这是Ag（110）切割面 这是CuO（100）切割面  我想算的是这两个面之间的结合情况，或者说CuO（100）在Ag（110）上的生长吧，因此觉得Ag（110）应该接着CuO（100），中间不加真空。 但是在build layer中有build layer structure as a crycal和 build layer structure as a surface，只是知道 crycal建出来是周期结构，surface好像不是周期，目前还不大明白要解决我的问题该选哪个。 目前感觉最像我想要的结构就是，直接用两个切割后的面build layer，选 as a crycal，效果如下：  但这样两个切面并不是面对面的，注意看CuO中那个单独的红色的原子，它并不在CuO（100）的切割面上，而是内部的，看上面对应的CuO（100）切割面图就知道了。这样最后的结构就是一层Ag再接着一层CuO，按ABABABABAB……这样下去，这不是我想要的。我想要的就是中间是Ag（110）面连着CuO（100）面（或者说平行吧），Ag（110）面一侧始终是Ag的周期机构，CuO（100）面一侧也始终是CuO的周期结构了。这个意思MS能办到吗？难道我从想法就错了？？？ 如果选as a surface，也直接用两个切割后的面build layer，如下图  这样倒是没有Ag和CuO按ABABABA这样的周期性了，但上下两块之间并没有白色的box围着，感觉跟一般文献中的图都不一样。而且Ag（110）面也并没有对着CuO（100）面，也不是我想要的。 看资料都说切后的面要加真空，然后再作下一步操作 加了真空后，真空层外多出些原子，这个是怎么回事，有什么影响吗？如下：  这是CuO的  这时不管是按crycal还是surface，比起前面的图，也就是多了真空层，以及多出来的原子，如图 这是按crycal合并的，上下都有多的原子，倒是反映周期性了  这是按surfac合并的，也差不多  不知各位达人看明白没有？我觉得我还是应该用surfac来合并吧，关键是怎么让两边切面对切面，难道我的想法和操作都错了，诚望指教，虽散尽金子亦必谢！！！ [ Last edited by 8240668 on 2010-6-9 at 19:19 ] |
3楼2010-06-09 19:05:15
zxzj05
荣誉版主 (著名写手)
- 1ST强帖: 1
- 应助: 0 (幼儿园)
- 贵宾: 1.242
- 金币: 5912.5
- 红花: 2
- 帖子: 1528
- 在线: 144.5小时
- 虫号: 406147
- 注册: 2007-06-18
- 性别: GG
- 专业: 金属功能材料
- 管辖: 第一性原理
4楼2010-06-09 20:30:58
