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【求助】build layer合并两个界面时的小问题 已有4人参与
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我想算两种物质之间的结合能，就是把切割后的两个面拼接到一起。目前问题如下： 1。cleave后，我看help中说要进行Re-orient，方向改来改去也没看出个所以然，好像没什么区别，这步到底有什么作用，谢谢？ 2。关键问题是：用build layer合并切割面时，如何让这两个切割面相对，或者说是接触（即中间真空设为0时），我这老是下层切割面连着上层的周期结构，再上去才是上层的切割面，我的意思是想把上层反个头。这样才是中间接触，界面两边是两种物质的周期性结构，这才是我想要的结构。 3。按理说，cleave后的面应该几何优化后再去build layer，我想算两种物质之间的结合能是不是不用先优化面哦，直接用切后的面build layer？因为优化后都带着真空层，最后build layer后还要想法去掉真空层吧，此外我还发现优化后，原子之间会成健，rebuild后虽然键消失，但真空层外端却多出现数个原子，然后再用这时的结构去build layer，最后的结构也多出现些原子，是不是“rebuild后虽然键消失，但真空层外端却多出现数个原子，”这步就更没有必要哦？ |
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acridine
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8240668(金币+2):谢谢参与
zzy870720z(金币+3):谢谢指导，期待您更好的表现 2010-06-08 21:27:18
xiaohunhun(金币+1):xiexie 2010-06-08 23:32:09
8240668(金币+20):太谢谢你的回复了！之前是不怎么会贴图，我马上上图，强烈期待着你再来指导！ 2010-06-09 16:36:51
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xiaohunhun(金币+1):xiexie 2010-06-08 23:32:09
8240668(金币+20):太谢谢你的回复了！之前是不怎么会贴图，我马上上图，强烈期待着你再来指导！ 2010-06-09 16:36:51
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这位兄弟还是截几个图吧，这种问题仅仅靠语言描述太难以说清楚了。 1。关于Re-orient，我知道建立表面或其他超胞的时候有个选项是用来设置晶体坐标系a、b、c和空间坐标系x、y、z的关系，诸如另c与z方向一致之类的。不知道楼主说的是否是这个地方的设置，这并不影响你的计算。如果不是这个设置，那最好贴个图出来。 2。这个问题没太看懂，尤其是“下层切割面连接着上面的周期结构”，最好贴个图。不过提醒你的是最后建立的模型中肯定是两个界面的，即整个模型实际上描述的是两个slab层交替出现的周期排列(|AB|=...ABABABABAB...，而仔细想一下你会发现，你的超胞|AB|中是有两个界面的)，不可能出现你说的一个界面，两侧是纯周期结构的情况。 3。如果你建立的是界面模型，那么没有必要优化表面，除非你强调的是“发生表面重构之后，才进一步形成的界面”。 另外后面说的“真空层外端却多出现数个原子”，这个实在难以抽象出来是什么样子的，最好截图。 “两种物质之间的结合能”，这个说法比较怪异，最好确定一下，你是不是想分析界面能，或界面形成能之类的。 |
2楼2010-06-08 20:31:46
acridine
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6楼2010-06-10 18:01:31