应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 【求助】ATK优化
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
81/1返回列表
查看: 1744  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

kaypu

铁杆木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】ATK优化 已有4人参与

如何在ATK中研究输运时，对双电极和分子进行优化，是否要固定电极和中心散射区的电极 怎么固定？ 就是在Geometric Constraints中写入什么？是不是写入中心散射区电极的编号比如0，1，2，3，4，5，6，。。。像是这样的数字，要是这么写的话 那电极的编号是多少？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-05-27 21:44:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

163.com

金虫 (著名写手)

实习版主
★
kaypu(金币+1): 2010-05-28 07:37:52
aylayl08(金币+1):谢谢 2010-09-29 19:04:39
一般要先优化，可以用VASP来做优化，ATK做输运。

  ATK优化不要你自己固定原子的，软件自己来处理
赞一下(1人) 回复此楼
阿什顿联
2楼2010-05-27 21:57:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kaypu

铁杆木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by kaypu at 2010-05-27 21:44:18:
如何在ATK中研究输运时，对双电极和分子进行优化，是否要固定电极和中心散射区的电极 怎么固定？ 就是在Geometric Constraints中写入什么？是不是写入中心散射区电极的编号比如0，1，2，3，4，5，6，。。。像是这 ...


我的意思是想不好确定分子与电极的距离 想通过atk优化得到最稳定的分子与电极距离，然后通过上图中的设置，请问一下这样不用固定电极和表面层吗？ 要使用固定的话怎么固定呀，上面的数怎么选择？
赞一下 回复此楼
3楼2010-05-28 07:42:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

163.com

金虫 (著名写手)

实习版主
★
kaypu(金币+2): 2010-05-29 08:37:00
zzy870720z(金币+1):谢谢指导 2010-05-29 09:35:14
引用回帖:
Originally posted by kaypu at 2010-05-28 07:42:27:


我的意思是想不好确定分子与电极的距离 想通过atk优化得到最稳定的分子与电极距离，然后通过上图中的设置，请问一下这样不用固定电极和表 ...

你分子与电极的距离是要你用经验参数来确定的，设置只是一个优化精度的要求，你的原子力用0.02 或者0.05都可以，越小越难算。

那个Max Steps就是最大步数，最多让软件算到多少步，超过步数就会自动截止，这要看你的实际情况。 建议稍微取大一点
赞一下(1人) 回复此楼
阿什顿联
4楼2010-05-29 00:15:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kaypu

铁杆木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 163.com at 2010-05-29 00:15:52:



你分子与电极的距离是要你用经验参数来确定的，设置只是一个优化精度的要求，你的原子力用0.02 或者0.05都可以，越小越难算。

那个Max Steps就是最大步数，最多让软件算到多少步，超过步数就会自动截止， ...

下面的几何限定怎么设置呀，我想把电极和表面层的都限定住，在那个里面应该如何设置，表面层的原子标号和电极的原子标号如何表示？ 谢谢
赞一下 回复此楼
5楼2010-05-29 08:38:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

youngjfly

银虫 (初入文坛)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
aylayl08(金币+1):谢谢指点 2010-09-29 19:04:55
引用回帖:
Originally posted by kaypu at 2010-05-29 08:38:38:

下面的几何限定怎么设置呀，我想把电极和表面层的都限定住，在那个里面应该如何设置，表面层的原子标号和电极的原子标号如何表示？ 谢谢

里面的设定是从屏蔽层开始的，0表示散射区第一个原子，依次把需要固定的原子序数输入进去就行。（注意，从散射区的电极原子开始）
赞一下(2人) 回复此楼
真的很想把你搞好。
6楼2010-09-29 16:31:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kaypu

铁杆木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by youngjfly at 2010-09-29 16:31:56:



里面的设定是从屏蔽层开始的，0表示散射区第一个原子，依次把需要固定的原子序数输入进去就行。（注意，从散射区的电极原子开始）

非常感谢
回复此楼
7楼2010-09-30 08:52:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ghostsyd

铜虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请问楼主是通过输入坐标来构建分子的吗？
赞一下 回复此楼
物理妹子伤不起。。。。。
8楼2012-07-30 02:21:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 kaypu 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 学硕274求调剂 +8 Li李鱼 2026-03-26 8/400 2026-03-28 16:53 by xuxiang
[考研] 调剂310 +6 温柔的晚安 2026-03-25 7/350 2026-03-28 16:04 by qq2000
[考研] 085602 化工专硕 338分 求调剂 +12 路痴小琪 2026-03-27 12/600 2026-03-28 15:41 by L135790
[考研] 求调剂 +6 争取九点睡 2026-03-28 6/300 2026-03-28 14:14 by Ainin_
[考研] 0703化学求调剂 +9 奶油草莓. 2026-03-22 10/500 2026-03-28 13:30 by 唐沐儿
[考博] 26申博 +3 加油冲啊！ 2026-03-26 3/150 2026-03-27 15:38 by cls512
[考研] 274求调剂 +17 顾九笙要谦虚 2026-03-24 23/1150 2026-03-27 15:16 by caszguilin
[考研] 一志愿吉大071010，316分求调剂 +3 xgbiknn 2026-03-27 3/150 2026-03-27 10:36 by guoweigw
[考研] 0703化学338求调剂！ +6 Zuhui0306 2026-03-26 7/350 2026-03-27 10:35 by shangxh
[考研] 316求调剂 +5 江辞666 2026-03-26 5/250 2026-03-27 08:08 by hypershenger
[考研] 351求调剂 +4 麦克阿磊 2026-03-24 4/200 2026-03-27 00:32 by wxiongid
[考研] 281求调剂 +3 亚克西good 2026-03-26 5/250 2026-03-26 19:48 by 不吃魚的貓
[考研] 340求调剂 +3 Amber00 2026-03-26 3/150 2026-03-26 18:57 by 不吃魚的貓
[考研] 材料专硕 335 分求调剂 +4 拒绝冷暴力 2026-03-25 4/200 2026-03-25 18:45 by haxia
[考研] 0854电子信息求调剂 324 +4 Promise-jyl 2026-03-23 4/200 2026-03-25 11:36 by Sugarlight
[考研] 材料专硕331求调剂 +4 鲜当牛 2026-03-24 4/200 2026-03-24 15:58 by JourneyLucky
[考研] 341求调剂(一志愿湖南大学070300) +5 番茄头--- 2026-03-22 6/300 2026-03-23 23:45 by Txy@872106
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境，总分308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-23 8/400 2026-03-23 20:36 by Creta
[考研] 070300，一志愿北航320求调剂 +3 Jerry0216 2026-03-22 5/250 2026-03-23 09:16 by 。。堂堂
[考研] 求调剂 +5 Zhangbod 2026-03-21 7/350 2026-03-22 13:13 by Zhangbod
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭