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【分享】处理DOSCAR文件的脚本和程序
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根据JMS NRL的split_dos脚本稍做修改，使得能够处理从s到d所有18个轨道（包括自旋上下）的DOSCAR，生成每个原子的轨道态密度，然后自己写了一个C程序，可以把同类原子的p轨道和d的t2g，eg轨道分别求和生成新的轨道态密度文件。适用于对含过渡金属元素体系的电子态密度进行处理，可以很方便的得到p轨道和t2g，eg轨道的总态密度。 使用方法： 仅限linux平台 1、把三个脚本程序解压后放到一个/bin目录并把路径添加到环境变量里（或者把三个文件都放到要处理的数据所在目录）。 2、键入split_dos.ksh运行分解DOSCAR的脚本，得到体系总的和每个原子的分波态密度。 3、键入sumdos *1 *2 *3执行求p以及t2g，eg轨道态密度和，其中*1, *2, *3为三个参数，依次为要处理的元素符号（如Fe），起始原子序号，最终原子序号（比如Fe原子在POSCAR里面是第5到13号原子，则*2和*3分别为5 13）。 http://d.namipan.com/d/bd4ee2bb9 ... 5c2334a0697fb150000 注意！！！！：sumdos的使用仅限于t2g和eg分别简并得很好的情况，即它们内部不再分裂，因为程序只是简单的把dxy, dyz, dzx和dz2, dx2分别加起来！如果有较强退简并情况，如晶体形变造成t2g和eg再分裂，请勿用此程序！ [ Last edited by nkleof on 2010-5-24 at 11:14 ] |
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zzy870720z(金币+2):感谢解答 2010-05-26 17:59:34
zzy870720z(金币+2):感谢解答 2010-05-26 17:59:34
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我看过他的回帖，实际上就是，假如把dxy, dyz, dzx, dx2, dz2看作5个线性无关项，那么当vasp所采用的坐标系不和所定义的x, y, z重合时，输出的5个轨道可以看做是这5个轨道的线性组合。我不确定vasp是不是会采用一套很特别的坐标系，但是我通常建模型都是用内坐标也就是direct模式，所以得到的结果应该是xyz就是晶体场坐标。 我写的那个sumdos程序只是对特定的几列进行简单加和，所以只适用于特定情况，否则不保证加出来的t2g和eg正确。我在尖晶石结构中使用过，是适用于内坐标建模的尖晶石结构的。 因此提醒注意，如果使用那个程序，应在使用前看看10和11，12和13，16和17这三组列数据（分别对应自旋向上和向下）是不是对应简并的t2g三个轨道态密度，14和15，18和19这两组列数据是不是对应eg轨道态密度。 [ Last edited by nkleof on 2010-5-26 at 17:14 ] |
12楼2010-05-26 14:55:55
2楼2010-05-24 11:42:09
3楼2010-05-25 09:09:23
4楼2010-05-25 09:13:25
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