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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2025级博士研究生招生报考通知
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cjlcjl8592

木虫 (著名写手)

[交流] 【请教】AB类错误,如何解决?请帮忙。已有2人参与

Alert level A
SHFSU01_ALERT_2_A  The absolute value of parameter shift to su ratio > 0.20
            Absolute value of the parameter shift to su ratio given   0.844
            Additional refinement cycles may be required.
PLAT080_ALERT_2_A Maximum Shift/Error ............................       0.84      


Alert level B
PLAT111_ALERT_2_B ADDSYM Detects (Pseudo) Centre of Symmetry .....         95 PerFi
PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for    C22    --  C23     ..       7.39 su   
PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for    C30    --  C31     ..       7.85 su   
PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for    C52    --  C53     ..       8.82 su   
PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for    C62    --  C67     ..       8.47 su   
PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for    C70    --  C71     ..       7.68 su   
PLAT241_ALERT_2_B Check High      Ueq as Compared to Neighbors for        C13     
PLAT241_ALERT_2_B Check High      Ueq as Compared to Neighbors for        C38     
PLAT241_ALERT_2_B Check High      Ueq as Compared to Neighbors for        C52     
PLAT241_ALERT_2_B Check High      Ueq as Compared to Neighbors for        C77     
PLAT341_ALERT_3_B Low Bond Precision on  C-C Bonds (x 1000) Ang ..         20      
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor       OW     -   HW1    ...          ?      
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor       OW     -   HW2    ...          ?      
PLAT234_ALERT_4_B Large Hirshfeld Difference C37    --  C38     ..       0.26 Ang.
--------------------------------------------------------------------------------

[ Last edited by cjlcjl8592 on 2010-5-20 at 08:25 ]
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cjlcjl8592

木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by huhongfan0926 at 2010-05-12 11:17:36:
不收敛可能跟你用了太多限制有关系。
你用dfix是固定苯环? 如果是的话直接在苯环原子前加afix 66即可
另外delu 0.005 atom1 atom2用在你B类的Hirshfeld提示错误,可能会有所改善.

我改用afix 66, 结果如下:请问如何解决。(限制条件提示有13个,结果稍好)
Alert level A
SHFSU01_ALERT_2_A  The absolute value of parameter shift to su ratio > 0.20
            Absolute value of the parameter shift to su ratio given   0.935
            Additional refinement cycles may be required.
PLAT080_ALERT_2_A Maximum Shift/Error ............................       0.94      
PLAT241_ALERT_2_A Check High      Ueq as Compared to Neighbors for        C85     


Alert level B
PLAT111_ALERT_2_B ADDSYM Detects (Pseudo) Centre of Symmetry .....         95 PerFi
PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for    C22    --  C23     ..       9.26 su   
PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for    C52    --  C53     ..       7.80 su   
PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for    C62    --  C67     ..      10.42 su   
PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for    C85    --  C86     ..       9.70 su   
PLAT241_ALERT_2_B Check High      Ueq as Compared to Neighbors for        C13     
PLAT241_ALERT_2_B Check High      Ueq as Compared to Neighbors for        C38     
PLAT241_ALERT_2_B Check High      Ueq as Compared to Neighbors for        C44     
PLAT241_ALERT_2_B Check High      Ueq as Compared to Neighbors for        C46     
PLAT241_ALERT_2_B Check High      Ueq as Compared to Neighbors for        C52     
PLAT241_ALERT_2_B Check High      Ueq as Compared to Neighbors for        C65     
PLAT241_ALERT_2_B Check High      Ueq as Compared to Neighbors for        C77     
PLAT332_ALERT_2_B Large Phenyl C-C Range           C30    -C35           0.26 Ang.
PLAT332_ALERT_2_B Large Phenyl C-C Range           C50    -C55           0.27 Ang.
PLAT341_ALERT_3_B Low Bond Precision on  C-C Bonds (x 1000) Ang ..         20      
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor       OW     -   HW1    ...          ?      
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor       OW     -   HW2    ...          ?      
PLAT234_ALERT_4_B Large Hirshfeld Difference C84    --  C85     ..       0.25 Ang.
PLAT731_ALERT_1_B Bond    Calc     1.51(3), Rep    1.504(5) ......       6.00 su-Ra
              C01  -C02     1.555   1.555
6楼2010-05-14 09:58:16
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huhongfan0926

金虫 (小有名气)

★ ★
cjlcjl8592(金币+1):谢谢参与
wsht212(金币+1):谢谢交流,希望常来! 2010-05-11 21:40:53
cjlcjl8592(金币+3): 2010-05-11 22:54:37
A类错误可以通过增加精修轮数解决!
B类第一个可能是存在赝对称结构。
后面的可以尝试
delu 0.005 atom1 atom2
2楼2010-05-11 19:55:30
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cjlcjl8592

木虫 (著名写手)

wsht212:谢谢交流,希望常来! 2010-05-11 23:12:49
引用回帖:
Originally posted by huhongfan0926 at 2010-05-11 19:55:30:
A类错误可以通过增加精修轮数解决!
B类第一个可能是存在赝对称结构。
后面的可以尝试
delu 0.005 atom1 atom2

我的晶体精修有点不收敛,不知道为什么?所以出现A类错误呀

delu 0.005 atom1 atom2 [/quote]???
我用了如下命令,有问题???
dfix 1.385 0.008 c16 c17 c17 c18 c18 c19 c19 c20 c20 c21 c21 c16
simu c16 c17 c18 c19 c20 c21
delu c16 c17 c18 c19 c20 c21
3楼2010-05-11 23:02:43
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huhongfan0926

金虫 (小有名气)


wsht212(金币+1):谢谢交流,希望常来! 2010-05-13 08:13:13
cjlcjl8592(金币+10): 2010-05-14 08:46:08
cjlcjl8592(金币+5):非常感谢! 2010-05-14 08:46:41
不收敛可能跟你用了太多限制有关系。
你用dfix是固定苯环? 如果是的话直接在苯环原子前加afix 66即可
另外delu 0.005 atom1 atom2用在你B类的Hirshfeld提示错误,可能会有所改善.
4楼2010-05-12 11:17:36
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