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CADD

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助完结】COMFA q2为负值 已有2人参与

最近在做COMFA,但是结果不好,q2甚至出现负值。

分别用对接结果,ALIGNDATABASE,药效团做COMFA,结果都不好,q2最大只到

0.3多。恳请那位高手指点一下。很急,谢谢。

[ Last edited by CADD on 2010-5-13 at 21:25 ]
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ky96998

金虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-05-05 12:04:13
如果活性数据可靠,那主要是对接构象的选取和叠合的问题
5楼2011-05-05 11:04:17
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查看全部 7 个回答

Cyberman

金虫 (小有名气)


lei0736(金币+1):谢谢 2010-05-11 20:13:16
CADD(金币+2):谢谢回帖,我用的是IC50。现在问题已经解决了。 2010-05-12 16:38:59
请问你用的是什么活性?如果是抑制率等一定不好,好也没有!
活性最好用IC50或DC50等有意义的。
2楼2010-05-11 19:26:31
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tingjun

木虫 (小有名气)


lei0736(金币+1):谢谢 2010-05-11 20:13:23
CADD(金币+2):谢谢回帖,现在问题已经解决了,应该是构象没挑好吧。 2010-05-12 16:40:04
是不是分组的问题,有些例外点,或者你看看构象
3楼2010-05-11 19:54:27
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zsj1012

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by CADD at 2010-05-04 22:10:12:
最近在做COMFA,但是结果不好,q2甚至出现负值。

分别用对接结果,ALIGNDATABASE,药效团做COMFA,结果都不好,q2最大只到

0.3多。恳请那位高手指点一下。很急,谢谢。

[ Last edited by CADD on 2010- ...

活性数据只要有物理化学意义就可以吧,为什么最好是IC50?
看的远,走的远
4楼2011-05-05 10:17:11
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