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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助完结】COMFA q2为负值
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CADD

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助完结】COMFA q2为负值 已有2人参与

最近在做COMFA，但是结果不好，q2甚至出现负值。

分别用对接结果，ALIGNDATABASE，药效团做COMFA，结果都不好，q2最大只到

0.3多。恳请那位高手指点一下。很急，谢谢。

[ Last edited by CADD on 2010-5-13 at 21:25 ]
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1楼 2010-05-04 22:10:12
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Cyberman

金虫 (小有名气)
★
lei0736(金币+1):谢谢 2010-05-11 20:13:16
CADD(金币+2):谢谢回帖，我用的是IC50。现在问题已经解决了。 2010-05-12 16:38:59
请问你用的是什么活性？如果是抑制率等一定不好，好也没有！
活性最好用IC50或DC50等有意义的。
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2楼2010-05-11 19:26:31
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tingjun

木虫 (小有名气)
★
lei0736(金币+1):谢谢 2010-05-11 20:13:23
CADD(金币+2):谢谢回帖，现在问题已经解决了，应该是构象没挑好吧。 2010-05-12 16:40:04
是不是分组的问题，有些例外点，或者你看看构象
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3楼2010-05-11 19:54:27
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zsj1012

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by CADD at 2010-05-04 22:10:12:
最近在做COMFA，但是结果不好，q2甚至出现负值。

分别用对接结果，ALIGNDATABASE，药效团做COMFA，结果都不好，q2最大只到

0.3多。恳请那位高手指点一下。很急，谢谢。

[ Last edited by CADD on 2010- ...

活性数据只要有物理化学意义就可以吧，为什么最好是IC50?
赞一下(1人) 回复此楼
看的远，走的远
4楼2011-05-05 10:17:11
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ky96998

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-05-05 12:04:13
如果活性数据可靠，那主要是对接构象的选取和叠合的问题
赞一下(2人) 回复此楼
5楼2011-05-05 11:04:17
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superfcc

禁虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
本帖内容被屏蔽
6楼2011-05-06 10:54:43
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chemozhang

木虫 (正式写手)
帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《Sybyl 常见问题及使用教程》
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故地如重游月圆更寂寞
7楼2011-09-05 19:22:23
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