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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】关于同源模建的问题，还望大家帮一下忙
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张军帅

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】关于同源模建的问题，还望大家帮一下忙 已有3人参与

各位师兄师姐们，我在用同MOE的时候遇到一个问题，由于我的MOE版本是08的，所以我在ncbi上搜索到最新的pdb文件，怎么才能导入到moe里做同源模建呢，还望大家不吝赐教，我不胜感激
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人生若只如初见
1楼 2010-04-30 09:13:18
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手
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ghcacj(金币+2):谢谢 2010-04-30 13:33
引用回帖:
Originally posted by 张军帅 at 2010-04-30 11:26:44:

因为我电脑上当时给装了个MOE，就想用这个试试，问一下，MODELLER是免费的吗？

呵呵~如果MOE没有授权，你是不能拿来发文章的，MODELLER是免费的~这个你放心好啦~哈哈~还有个配套的GUI,可以使同源模建的过程更轻松，具体的内容可以参考一下我在这个板块发的同源模建的帖子，虽然不太成熟，希望对你能有点帮助
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6楼2010-04-30 13:22:08
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手
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ghcacj(金币+1):谢谢 2010-04-30 10:24
引用回帖:
Originally posted by 张军帅 at 2010-04-30 09:13:18:
各位师兄师姐们，我在用同MOE的时候遇到一个问题，由于我的MOE版本是08的，所以我在ncbi上搜索到最新的pdb文件，怎么才能导入到moe里做同源模建呢，还望大家不吝赐教，我不胜感激

pdb不会涉及新旧的问题啊~只要有PDB号就可以导入的啊~
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2楼2010-04-30 10:08:48
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张军帅

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by zh1987hs at 2010-04-30 10:08:48:

pdb不会涉及新旧的问题啊~只要有PDB号就可以导入的啊~

那我在NCBI上搜到的，为什么在MOE上就没有呢，还望您能解释明白一点，我刚接触这个，还不太懂
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人生若只如初见
3楼2010-04-30 10:26:22
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手
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lei0736(金币+2):谢谢 2010-04-30 12:25
引用回帖:
Originally posted by 张军帅 at 2010-04-30 10:26:22:

那我在NCBI上搜到的，为什么在MOE上就没有呢，还望您能解释明白一点，我刚接触这个，还不太懂

你一定要用MOE进行同源模建吗？我没用过MOE,因为这是个商业软件，老板不给买。事实上用于做同源模建的服务器和软件很多，SWISS-MODEL和MODELLER都可以，尤其推荐用MODELLER。
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4楼2010-04-30 10:59:40
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