24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1434  |  回复: 10

张军帅

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】关于同源模建的问题,还望大家帮一下忙 已有3人参与

各位师兄师姐们,我在用同MOE的时候遇到一个问题,由于我的MOE版本是08的,所以我在ncbi上搜索到最新的pdb文件,怎么才能导入到moe里做同源模建呢,还望大家不吝赐教,我不胜感激
回复此楼
人生若只如初见
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-04-30 10:24
引用回帖:
Originally posted by 张军帅 at 2010-04-30 09:13:18:
各位师兄师姐们,我在用同MOE的时候遇到一个问题,由于我的MOE版本是08的,所以我在ncbi上搜索到最新的pdb文件,怎么才能导入到moe里做同源模建呢,还望大家不吝赐教,我不胜感激

pdb不会涉及新旧的问题啊~只要有PDB号就可以导入的啊~
2楼2010-04-30 10:08:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

张军帅

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zh1987hs at 2010-04-30 10:08:48:

pdb不会涉及新旧的问题啊~只要有PDB号就可以导入的啊~

那我在NCBI上搜到的,为什么在MOE上就没有呢,还望您能解释明白一点,我刚接触这个,还不太懂
人生若只如初见
3楼2010-04-30 10:26:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+2):谢谢 2010-04-30 12:25
引用回帖:
Originally posted by 张军帅 at 2010-04-30 10:26:22:

那我在NCBI上搜到的,为什么在MOE上就没有呢,还望您能解释明白一点,我刚接触这个,还不太懂

你一定要用MOE进行同源模建吗?我没用过MOE,因为这是个商业软件,老板不给买。事实上用于做同源模建的服务器和软件很多,SWISS-MODEL和MODELLER都可以,尤其推荐用MODELLER。
4楼2010-04-30 10:59:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

张军帅

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zh1987hs at 2010-04-30 10:59:40:

你一定要用MOE进行同源模建吗?我没用过MOE,因为这是个商业软件,老板不给买。事实上用于做同源模建的服务器和软件很多,SWISS-MODEL和MODELLER都可以,尤其推荐用MODELLER。

因为我电脑上当时给装了个MOE,就想用这个试试,问一下,MODELLER是免费的吗?
人生若只如初见
5楼2010-04-30 11:26:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-04-30 13:33
引用回帖:
Originally posted by 张军帅 at 2010-04-30 11:26:44:

因为我电脑上当时给装了个MOE,就想用这个试试,问一下,MODELLER是免费的吗?

呵呵~如果MOE没有授权,你是不能拿来发文章的,MODELLER是免费的~这个你放心好啦~哈哈~还有个配套的GUI,可以使同源模建的过程更轻松,具体的内容可以参考一下我在这个板块发的同源模建的帖子,虽然不太成熟,希望对你能有点帮助
6楼2010-04-30 13:22:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

张军帅

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zh1987hs at 2010-04-30 13:22:08:

呵呵~如果MOE没有授权,你是不能拿来发文章的,MODELLER是免费的~这个你放心好啦~哈哈~还有个配套的GUI,可以使同源模建的过程更轻松,具体的内容可以参考一下我在这个板块发的同源模建的帖子,虽然不太成熟,希 ...

呵呵,谢谢啊,我试试看吧
人生若只如初见
7楼2010-05-04 08:13:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gql119

铜虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by zh1987hs at 2010-04-30 13:22:08:

呵呵~如果MOE没有授权,你是不能拿来发文章的,MODELLER是免费的~这个你放心好啦~哈哈~还有个配套的GUI,可以使同源模建的过程更轻松,具体的内容可以参考一下我在这个板块发的同源模建的帖子,虽然不太成熟,希 ...

MODELLER若没有授权,文章能拿来发吗?
8楼2010-05-07 12:24:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by gql119 at 2010-05-07 12:24:41:

MODELLER若没有授权,文章能拿来发吗?

这个倒真没试过~因为这个注册一下就可以了~很简单的啊~
9楼2010-05-07 12:34:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gql119

铜虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
一定要试试,嘿嘿
10楼2010-05-07 12:50:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 张军帅 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 284求调剂 +5 archer.. 2026-04-10 5/250 2026-04-10 10:36 by cal0306
[考研] 材料专业344求调剂 +8 hualkop 2026-04-10 9/450 2026-04-10 10:28 by aholic77
[考研] 材料调剂 +5 hzhahg 2026-04-06 5/250 2026-04-10 10:10 by may_新宇
[考研] 085402通信工程调剂,有4项学科竞赛国奖(电赛国二),硕士研究生调剂自荐信。 +3 m永o不v言o弃m 2026-04-09 3/150 2026-04-09 17:17 by 紫曦紫棋
[考研] 085600材料与化工,求调剂 +11 won_qii 2026-04-07 11/550 2026-04-09 17:03 by luoyongfeng
[考研] 070300化学学硕311分求调剂 +18 梁富贵险中求 2026-04-04 20/1000 2026-04-09 11:18 by 哒哒哒呱呱呱
[考研] 招收有机化学、化工,药学,食品灯专业学生 +3 yrfhjgdj 2026-04-08 3/150 2026-04-09 10:15 by QYQX_123
[考研] 一志愿鲁东大学071000生物学学硕初试分数276求调剂 +3 慕绝cc 2026-04-09 3/150 2026-04-09 09:57 by liuhuiying09
[考研] 327求调剂 +12 Xxjc1107. 2026-04-06 12/600 2026-04-08 16:46 by luoyongfeng
[考研] 一志愿华东理工085601材料工程303分求调剂 +15 a1708 2026-04-06 15/750 2026-04-08 16:23 by luoyongfeng
[考研] 298求调剂 +4 残荷新柳 2026-04-07 4/200 2026-04-07 23:02 by lbsjt
[考研] 材料求调剂 +18 一样YWY 2026-04-05 18/900 2026-04-07 15:49 by dxlg
[考研] 316求调剂 +7 yyx想调剂 2026-04-05 7/350 2026-04-07 14:31 by shdgaomin
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +5 崔wj 2026-04-05 5/250 2026-04-06 15:40 by lin-da
[考研] 085500机械专硕初试288求调剂 +3 GZJguo666- 2026-04-05 3/150 2026-04-05 18:06 by jkddd
[考研] 288求调剂,一志愿华南理工大学071005 +6 ioodiiij 2026-04-04 6/300 2026-04-05 10:09 by guoweigw
[考研] 085602调剂 初试总分335 +12 19123253302 2026-04-04 12/600 2026-04-05 08:08 by 544594351
[考研] 292求调剂 +11 2022080213 2026-04-04 13/650 2026-04-04 18:38 by macy2011
[考研] 本9一志愿2 0854低分专硕286求调剂 +9 芒种111 2026-04-04 9/450 2026-04-04 11:01 by tangruihua
[考研] 372分材料与化工(085600)一志愿湖南大学求调剂 +3 蓝笺片 2026-04-03 4/200 2026-04-03 17:58 by Jimmyandyou
信息提示
请填处理意见