| 查看: 876 | 回复: 4 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
| 【有奖交流】积极回复本帖子，参与交流，就有机会分得作者 coolrainbow 的 8 个金币 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
coolrainbow木虫 (著名写手)
未来国家冻凉
|
[交流]
【讨论】问个集群的问题 已有4人参与
|
||
|
我用的是我自己搭的集群，跑NAMD，所有软件（从mpich到charm到namd）都是用intel编译器编译的，网络是千兆网，每台机器是8核的，测了下加速比： 节点数 1 2 3 4 .... CPU数 8 16 24 32 加速比 1 1.8 0.16 0.17 .... 简直惨不忍睹啊，请问有什么方法能提高加速比？还有，从2到3的变化是不是太夸张了，是不是集群有什么缺陷呢？ PS：不要提infintband，没有钱~~~~~ |
回复此楼» 猜你喜欢
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急
已经有5人回复
-
2026国自然函评费到账
已经有12人回复
-
跳槽后在研项目怎么办？
已经有8人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急
已经有10人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急
已经有5人回复
-
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有7人回复
-
售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急
已经有5人回复
-
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有7人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有6人回复
superdirac
木虫 (正式写手)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 4269.5
- 散金: 33
- 红花: 2
- 帖子: 536
- 在线: 287.5小时
- 虫号: 522969
- 注册: 2008-03-12
- 专业: 理论和计算化学
5楼2010-04-22 09:04:31
bay__gulf
金虫 (著名写手)
刘苏州
- 模拟EPI: 8
- 应助: 9 (幼儿园)
- 贵宾: 4.85
- 金币: 2332.8
- 红花: 1
- 帖子: 1344
- 在线: 271小时
- 虫号: 592012
- 注册: 2008-09-03
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 分子模拟
★ ★ ★ ★
coolrainbow(金币+2):多谢建议 2010-04-22 08:34
lei0736(金币+4):谢谢 2010-04-22 09:50
coolrainbow(金币+2):多谢建议 2010-04-22 08:34
lei0736(金币+4):谢谢 2010-04-22 09:50
|
体系太小往往发挥不出并行效果来, 因为大部分的时间将花在任务分配和网络通讯上 推荐是3000+ atom/核心, 你的原子数多少, 可以试试不同原子数木的体系 2到3的确让人想不通, 像是算错小数点似的, 查看一下 前些天, 好像就是昨晚上, 遇到过一个出奇的慢的任务 发现是nfs 的server 负担太重限制了 PC机自己组的, 勉强能用而已, 3，4台机器同时大规模往那上面吞吐 撑到的硬盘的极限 不仅仅是核数和网络, 检查一下其他有没有瓶颈 [ Last edited by bay__gulf on 2010-4-21 at 22:12 ] |
2楼2010-04-21 22:11:35
zzy870720z
荣誉版主 (文坛精英)
- 应助: 47 (小学生)
- 贵宾: 9.05
- 金币: 30914.3
- 散金: 5613
- 红花: 68
- 沙发: 99
- 帖子: 12592
- 在线: 23567.6小时
- 虫号: 745488
- 注册: 2009-04-10
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
- 管辖: 分子模拟
3楼2010-04-21 23:56:46
coolrainbow
木虫 (著名写手)
未来国家冻凉
- 应助: 1 (幼儿园)
- 贵宾: 0.1
- 金币: 3979.5
- 散金: 10
- 红花: 50
- 帖子: 1137
- 在线: 272.3小时
- 虫号: 239560
- 注册: 2006-04-07
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
4楼2010-04-22 08:36:49
