24小时热门版块排行榜    

查看: 872  |  回复: 4
当前主题已经存档。
【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 coolrainbow 的 8 个金币

coolrainbow

木虫 (著名写手)

未来国家冻凉

[交流] 【讨论】问个集群的问题 已有4人参与

我用的是我自己搭的集群,跑NAMD,所有软件(从mpich到charm到namd)都是用intel编译器编译的,网络是千兆网,每台机器是8核的,测了下加速比:

节点数   1    2       3      4            ....
CPU数   8    16     24    32
加速比   1    1.8    0.16   0.17    ....

简直惨不忍睹啊,请问有什么方法能提高加速比?还有,从2到3的变化是不是太夸张了,是不是集群有什么缺陷呢?

PS:不要提infintband,没有钱~~~~~
回复此楼

» 猜你喜欢

技术博客:http://hi.baidu.com/coolrainbow/blog
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州

★ ★ ★ ★
coolrainbow(金币+2):多谢建议 2010-04-22 08:34
lei0736(金币+4):谢谢 2010-04-22 09:50
体系太小往往发挥不出并行效果来, 因为大部分的时间将花在任务分配和网络通讯上
推荐是3000+ atom/核心,
你的原子数多少, 可以试试不同原子数木的体系

2到3的确让人想不通, 像是算错小数点似的, 查看一下

前些天, 好像就是昨晚上, 遇到过一个出奇的慢的任务
发现是nfs 的server 负担太重限制了
PC机自己组的, 勉强能用而已, 3,4台机器同时大规模往那上面吞吐
撑到的硬盘的极限
不仅仅是核数和网络, 检查一下其他有没有瓶颈

[ Last edited by bay__gulf on 2010-4-21 at 22:12 ]
2楼2010-04-21 22:11:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主

★ ★
lei0736(金币+2):谢谢 2010-04-22 09:50
我们好像也是这种情况,VASP最多并行到3台机器
原子数太小肯定对测试影响很大,最好换个大体系测试
博学、审问、慎思、明辨、笃学
3楼2010-04-21 23:56:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

coolrainbow

木虫 (著名写手)

未来国家冻凉

引用回帖:
Originally posted by bay__gulf at 2010-04-21 22:11:35:
体系太小往往发挥不出并行效果来, 因为大部分的时间将花在任务分配和网络通讯上
推荐是3000+ atom/核心,
你的原子数多少, 可以试试不同原子数木的体系

2到3的确让人想不通, 像是算错小数点似的, 查看一下

...

我试验了4000到70000原子体系,加速比都是这个样子(显然不是小数点错了~~),其他瓶颈暂时想不出来
技术博客:http://hi.baidu.com/coolrainbow/blog
4楼2010-04-22 08:36:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

superdirac

木虫 (正式写手)


lei0736(金币+1):谢谢 2010-04-22 09:50
应该是 从 1,2,4,8,16...这样呈指数形式来测的!
我认为,酒一口一口喝,路一步一步走~步子迈大了,喀~容易扯着蛋
5楼2010-04-22 09:04:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 coolrainbow 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 人气不行了 +7 fansofjerry 2026-08-21 7/350 2026-08-21 14:13 by Vivilian
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +15 医学老男孩 2026-08-20 18/900 2026-08-21 13:46 by 医学老男孩
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +23 yaoyewhu2008 2026-08-20 25/1250 2026-08-21 12:19 by Poppy1104
[基金申请] 什么时候开奖? +7 CrisMessi 2026-08-18 7/350 2026-08-21 12:15 by weiyin
[基金申请] 时间戳又变了 +12 wuchongjun 2026-08-20 18/900 2026-08-21 11:53 by wuchongjun
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +15 archvillain 2026-08-15 27/1350 2026-08-21 11:32 by tim76
[基金申请] 科研孤儿太难了 +15 我4大白菜 2026-08-20 16/800 2026-08-21 11:07 by yming1319
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+4 snowwithsea 2026-08-19 13/650 2026-08-21 08:30 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 13/650 2026-08-19 21:28 by aasahr
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低?主要原因有哪些? +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 今天放榜吗? +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
信息提示
请填处理意见