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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 【求助】siesta3.0并行成功安装后不能并行的问题
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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雁儿霏霏

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】siesta3.0并行成功安装后不能并行的问题 已有3人参与

感谢zhangguangping和诸位虫友的帮助，siesta并行版已经安装完毕，在双核工作站上安装，但在并行时却发生下列问题：

[shang@node2 ChemicalPotential]$ /home/shang/mpich-1.2.7p1/bin/mpirun -np 2 siesta h2o_4.out
connect to address 192.168.0.2: Connection refused
Trying krb4 rsh...
connect to address 192.168.0.2: Connection refused
trying normal rsh (/usr/bin/rsh)
node2: Connection refused
forrtl: error (69): process interrupted (SIGINT)


请问这一问题应该如何解决？siesta单核计算没问题
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我美丽我漂亮我是青岛嫚！
1楼 2010-04-20 10:00:17
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hchfox

木虫 (正式写手)
★
雁儿霏霏(金币+2): 2010-04-20 15:32
zzy870720z(金币+1):谢谢提示 2010-07-14 08:21:05
"connect to address 192.168.0.2: Connection refused"....看看节点之间配置好了没。。。
引用回帖:
Originally posted by 雁儿霏霏 at 2010-04-20 10:00:17:
感谢zhangguangping和诸位虫友的帮助，siesta并行版已经安装完毕，在双核工作站上安装，但在并行时却发生下列问题：

[shang@node2 ChemicalPotential]$ /home/shang/mpich-1.2.7p1/bin/mpirun -np 2 siesta &l ...

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2楼2010-04-20 10:57:13
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
★
xiaohunhun(金币+1):xiexie 2010-04-20 11:55
雁儿霏霏(金币+4):感谢 2010-04-20 15:32
引用回帖:
Originally posted by 雁儿霏霏 at 2010-04-20 03:00:17:
感谢zhangguangping和诸位虫友的帮助，siesta并行版已经安装完毕，在双核工作站上安装，但在并行时却发生下列问题：

[shang@node2 ChemicalPotential]$ /home/shang/mpich-1.2.7p1/bin/mpirun -np 2 siesta &l ...

你生成了免SSH登录的密码了吗？
还有就是你的mpich去测试过了吗？去example下面的test， make一下，然后做一下测试看看mpich能不能正常并行（mpirun -np 2 cpi ）！
祝好运！
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弘德明志博学笃行
3楼2010-04-20 11:05:30
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
★
xiaohunhun(金币+1):xiexie 2010-04-20 11:56
引用回帖:
Originally posted by hchfox at 2010-04-20 03:57:13:
"connect to address 192.168.0.2: Connection refused"....看看节点之间配置好了没。。。


他现在看样子是在一个节点上算吧！这个节点总共就两个核！
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弘德明志博学笃行
4楼2010-04-20 11:07:40
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雁儿霏霏

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2010-04-20 11:05:30:

你生成了免SSH登录的密码了吗？
还有就是你的mpich去测试过了吗？去example下面的test， make一下，然后做一下测试看看mpich能不能正常并行（mpirun -np 2 cpi ）！
祝好运！

对于单节点双核，按照你所说的$ ssh-keygen -t rsa -P ''
产生id_rsa 和id_rsa.pub
然后
$cp id_rsa.pub authorized_keys
$chmod 500 *

执行
$ /home/shang/mpich-1.2.7p1/bin/mpirun -np 2 siesta h2o_4.out
仍然出现
connect to address 192.168.0.2: Connection refused
Trying krb4 rsh...
connect to address 192.168.0.2: Connection refused
trying normal rsh (/usr/bin/rsh)
node2: Connection refused
forrtl: error (69): process interrupted (SIGINT)

请问是哪里的原因？
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5楼2010-07-13 09:42:43
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+2):谢谢指点 2010-07-13 15:23:09
引用回帖:
Originally posted by 雁儿霏霏 at 2010-07-13 02:42:43:


对于单节点双核，按照你所说的$ ssh-keygen -t rsa -P ''
产生id_rsa 和id_rsa.pub
然后
$cp id_rsa.pub authorized_keys
$chmod 500 *

执行
$ /home/shang/mpich-1.2.7p1/bin/mpirun -np 2 siesta & ...

这个时候你还差一步。ssh 192.168.0.2 ,这个时候出现一个提示，输入yes,等一会儿就可以了。然后在运行一遍ssh 192.168.0.2，这个时候应该出现Last login: Thu Jul  3 09:53:18 2008 from shang的提示，别的就没有任何提示了，这说明正常了。就可以计算了。祝好运！
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弘德明志博学笃行
6楼2010-07-13 13:57:21
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雁儿霏霏

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2010-07-13 13:57:21:

这个时候你还差一步。ssh 192.168.0.2 ,这个时候出现一个提示，输入yes,等一会儿就可以了。然后在运行一遍ssh 192.168.0.2，这个时候应该出现Last login: Thu Jul  3 09:53:18 2008 from shang的提示，别的就没 ...

我试一下，
谢谢谢谢！
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7楼2010-07-13 15:44:28
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雁儿霏霏

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2010-07-13 13:57:21:

这个时候你还差一步。ssh 192.168.0.2 ,这个时候出现一个提示，输入yes,等一会儿就可以了。然后在运行一遍ssh 192.168.0.2，这个时候应该出现Last login: Thu Jul  3 09:53:18 2008 from shang的提示，别的就没 ...

按照你的方法操作后ssh 192.168.0.2，并没有出现提示，直接出现Last login:  Jul  14 09:53:18 2008，接着并行siesta还是
connect to address 192.168.0.2: Connection refused
Trying krb4 rsh...
connect to address 192.168.0.2: Connection refused

帮看看是啥原因，网上说似乎要配置ssh，我没有配置，不知道是否是这里的原因，谢谢！
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8楼2010-07-14 14:42:50
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雁儿霏霏

木虫 (正式写手)
连续运行多次ssh 192.168.0.2仍然是这样，有点郁闷
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9楼2010-07-14 14:43:45
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
hedaors(金币+1):谢谢回复！ 2010-07-14 17:09:43
引用回帖:
Originally posted by 雁儿霏霏 at 2010-07-14 07:43:45:
连续运行多次ssh 192.168.0.2仍然是这样，有点郁闷

那就把免密码登录的过程重复来一次。可能中间出问题了。这样生成的是节点内部并行的。不是跨节点并行的。
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弘德明志博学笃行
10楼2010-07-14 17:04:41
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