24小时热门版块排行榜    

查看: 1621  |  回复: 15

雁儿霏霏

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】siesta3.0并行成功安装后不能并行的问题 已有3人参与

感谢zhangguangping和诸位虫友的帮助,siesta并行版已经安装完毕,在双核工作站上安装,但在并行时却发生下列问题:

[shang@node2 ChemicalPotential]$ /home/shang/mpich-1.2.7p1/bin/mpirun -np 2 siesta h2o_4.out
connect to address 192.168.0.2: Connection refused
Trying krb4 rsh...
connect to address 192.168.0.2: Connection refused
trying normal rsh (/usr/bin/rsh)
node2: Connection refused
forrtl: error (69): process interrupted (SIGINT)


请问这一问题应该如何解决?siesta单核计算没问题
回复此楼
我美丽我漂亮我是青岛嫚!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hchfox

木虫 (正式写手)


雁儿霏霏(金币+2): 2010-04-20 15:32
zzy870720z(金币+1):谢谢提示 2010-07-14 08:21:05
"connect to address 192.168.0.2: Connection refused"....看看节点之间配置好了没。。。
引用回帖:
Originally posted by 雁儿霏霏 at 2010-04-20 10:00:17:
感谢zhangguangping和诸位虫友的帮助,siesta并行版已经安装完毕,在双核工作站上安装,但在并行时却发生下列问题:

[shang@node2 ChemicalPotential]$ /home/shang/mpich-1.2.7p1/bin/mpirun -np 2 siesta &l ...

2楼2010-04-20 10:57:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangguangping

木虫 (著名写手)


xiaohunhun(金币+1):xiexie 2010-04-20 11:55
雁儿霏霏(金币+4):感谢 2010-04-20 15:32
引用回帖:
Originally posted by 雁儿霏霏 at 2010-04-20 03:00:17:
感谢zhangguangping和诸位虫友的帮助,siesta并行版已经安装完毕,在双核工作站上安装,但在并行时却发生下列问题:

[shang@node2 ChemicalPotential]$ /home/shang/mpich-1.2.7p1/bin/mpirun -np 2 siesta &l ...

你生成了免SSH登录的密码了吗?
还有就是你的mpich去测试过了吗?去example下面的test, make一下,然后做一下测试看看mpich能不能正常并行(mpirun -np 2 cpi )!
祝好运!
弘德明志博学笃行
3楼2010-04-20 11:05:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangguangping

木虫 (著名写手)


xiaohunhun(金币+1):xiexie 2010-04-20 11:56
引用回帖:
Originally posted by hchfox at 2010-04-20 03:57:13:
"connect to address 192.168.0.2: Connection refused"....看看节点之间配置好了没。。。


他现在看样子是在一个节点上算吧!这个节点总共就两个核!
弘德明志博学笃行
4楼2010-04-20 11:07:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雁儿霏霏

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2010-04-20 11:05:30:

你生成了免SSH登录的密码了吗?
还有就是你的mpich去测试过了吗?去example下面的test, make一下,然后做一下测试看看mpich能不能正常并行(mpirun -np 2 cpi )!
祝好运!

对于单节点双核,按照你所说的$ ssh-keygen -t rsa -P ''
产生id_rsa 和id_rsa.pub
然后
$cp id_rsa.pub authorized_keys
$chmod 500 *

执行
$ /home/shang/mpich-1.2.7p1/bin/mpirun -np 2 siesta h2o_4.out
仍然出现
connect to address 192.168.0.2: Connection refused
Trying krb4 rsh...
connect to address 192.168.0.2: Connection refused
trying normal rsh (/usr/bin/rsh)
node2: Connection refused
forrtl: error (69): process interrupted (SIGINT)

请问是哪里的原因?
我美丽我漂亮我是青岛嫚!
5楼2010-07-13 09:42:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangguangping

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+2):谢谢指点 2010-07-13 15:23:09
引用回帖:
Originally posted by 雁儿霏霏 at 2010-07-13 02:42:43:


对于单节点双核,按照你所说的$ ssh-keygen -t rsa -P ''
产生id_rsa 和id_rsa.pub
然后
$cp id_rsa.pub authorized_keys
$chmod 500 *

执行
$ /home/shang/mpich-1.2.7p1/bin/mpirun -np 2 siesta & ...

这个时候你还差一步。ssh 192.168.0.2 ,这个时候出现一个提示,输入yes,等一会儿就可以了。然后在运行一遍ssh 192.168.0.2,这个时候应该出现Last login: Thu Jul  3 09:53:18 2008 from shang的提示,别的就没有任何提示了,这说明正常了。就可以计算了。祝好运!
弘德明志博学笃行
6楼2010-07-13 13:57:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雁儿霏霏

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2010-07-13 13:57:21:

这个时候你还差一步。ssh 192.168.0.2 ,这个时候出现一个提示,输入yes,等一会儿就可以了。然后在运行一遍ssh 192.168.0.2,这个时候应该出现Last login: Thu Jul  3 09:53:18 2008 from shang的提示,别的就没 ...

我试一下,
谢谢谢谢!
我美丽我漂亮我是青岛嫚!
7楼2010-07-13 15:44:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雁儿霏霏

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2010-07-13 13:57:21:

这个时候你还差一步。ssh 192.168.0.2 ,这个时候出现一个提示,输入yes,等一会儿就可以了。然后在运行一遍ssh 192.168.0.2,这个时候应该出现Last login: Thu Jul  3 09:53:18 2008 from shang的提示,别的就没 ...

按照你的方法操作后ssh 192.168.0.2,并没有出现提示,直接出现Last login:  Jul  14 09:53:18 2008,接着并行siesta还是
connect to address 192.168.0.2: Connection refused
Trying krb4 rsh...
connect to address 192.168.0.2: Connection refused

帮看看是啥原因,网上说似乎要配置ssh,我没有配置,不知道是否是这里的原因,谢谢!
我美丽我漂亮我是青岛嫚!
8楼2010-07-14 14:42:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雁儿霏霏

木虫 (正式写手)

连续运行多次ssh 192.168.0.2仍然是这样,有点郁闷
我美丽我漂亮我是青岛嫚!
9楼2010-07-14 14:43:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangguangping

木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
hedaors(金币+1):谢谢回复! 2010-07-14 17:09:43
引用回帖:
Originally posted by 雁儿霏霏 at 2010-07-14 07:43:45:
连续运行多次ssh 192.168.0.2仍然是这样,有点郁闷

那就把免密码登录的过程重复来一次。可能中间出问题了。这样生成的是节点内部并行的。不是跨节点并行的。
弘德明志博学笃行
10楼2010-07-14 17:04:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 雁儿霏霏 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求老师收留调剂 +4 jiang姜66 2026-03-14 5/250 2026-03-15 20:11 by Winj1e
[考研] 309求调剂 +4 花与叶@ 2026-03-10 4/200 2026-03-14 21:26 by a不易
[考研] 【0703化学调剂】-一志愿华中师范大学-六级475 +5 Becho359 2026-03-11 5/250 2026-03-14 11:35 by 哦哦123
[考研] 0703化学求调剂 +5 很老实人 2026-03-09 5/250 2026-03-14 02:57 by JourneyLucky
[考研] 一志愿天津大学,英一数二305分求调剂,四六级已过 +8 小小番的茄 2026-03-09 8/400 2026-03-14 01:53 by JourneyLucky
[考研] 295复试调剂 +5 简木ChuFront 2026-03-09 5/250 2026-03-14 01:29 by JourneyLucky
[考研] 0703求调剂 +7 jtyq001 2026-03-10 7/350 2026-03-14 01:06 by JourneyLucky
[考研] 308求调剂 +3 是Lupa啊 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:30 by JourneyLucky
[考研] 311求调剂 +8 zchqwer 2026-03-10 8/400 2026-03-14 00:01 by JourneyLucky
[考研] 341求调剂 +4 番茄头--- 2026-03-10 4/200 2026-03-13 23:12 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +9 ADT 2026-03-11 9/450 2026-03-13 21:55 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +5 一定有学上- 2026-03-12 5/250 2026-03-13 18:31 by ms629
[硕博家园] 深圳大学硕士招生(2026秋,传感器方向,仅录取第一志愿) +4 xujiaoszu 2026-03-11 7/350 2026-03-13 17:28 by xujiaoszu
[考研] 一志愿山大07化学 332分 四六级已过 本科山东双非 求调剂! +3 不想理你 2026-03-12 3/150 2026-03-13 14:18 by JourneyLucky
[考研] 0856化工原理 +6 z2839474511 2026-03-10 6/300 2026-03-13 10:41 by houyaoxu
[考研] 求调剂 资源与环境 285 +3 未名考生 2026-03-10 3/150 2026-03-13 10:31 by houyaoxu
[考研] 08食品或轻工求调剂,本科发表3篇sci一区top论文,一志愿南师大食品科学与工程 +3 我是一个兵, 2026-03-10 3/150 2026-03-13 10:21 by Yuyi.
[考研] 一志愿河海大学085900土木水利专硕279求调剂不挑专业 +4 SunWwWwWw 2026-03-10 8/400 2026-03-13 02:23 by SunWwWwWw
[考研] 341求调剂 +4 捣蛋猪猪 2026-03-11 4/200 2026-03-12 14:47 by ruiyingmiao
[考研] 调剂 +5 呵唔哦豁 2026-03-10 5/250 2026-03-10 22:00 by 28375m
信息提示
请填处理意见