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identation

金虫 (著名写手)

[资源] 【原创】ABINIT的一种晶体结构建模方法

以前，在论坛上看到不少帖子，ABINIT的建模方法都是采用natom+rprim+xred+acell来进行建模的，这包括abinit的说明中的例子也是这样。因此，这需要预先用MS建立晶体结构，然后make P1，再导出坐标，然后才能计算。
这里，介绍一种用natom+natrd+spgroup+brvltt+acell+angdeg+xred进行建模的方法
这种建模方法和MS的利用空间群和等效的晶体学位置进行建模的方式是一致的，个人感觉挺方便的。
具体参数的意义可在www.abinit.org中找到。
以PRL 100，186402的一篇文章为例，La2NiMnO6的晶体学数据如下表所示

我们用Monoclinic型为例子，其晶胞有20个原子，因此建模部分如下
spgroup 14
ntypat 57 28 25 8
natom 20
brvltt -1
natrd 6 #读入的原子数目，就是晶体学数据给出的有坐标的原子数目
typat 1 2 3 4 4 4 #表中给出的Monoclinic型La2NiMnO6晶体的数据分别是
                           # La Ni  Mn  O1 O2 O3
acell 5.467 5.510 7.751 Angstrom    #用埃做单位后面要加上Angstrom
                                                      #也可用Bohr做单位
angdeg 90.000 90.119 90.000
xred

[ Last edited by identation on 2010-4-8 at 23:57 ]

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1楼2010-04-08 09:47:40

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whyyzf5725

银虫 (正式写手)

应助: 0 (幼儿园)
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帖子: 357
在线: 96.4小时
虫号: 751457

我在建63的时候也有问题，不知道是什么原因

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15楼2010-09-07 09:41:50

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wenjlu

木虫 (正式写手)

应助: 12 (小学生)
金币: 1187
帖子: 461
在线: 406.1小时
虫号: 306067

★★★ 三星级,支持鼓励

★ ★ ★
wuli8(金币+1):感谢交流 2010-04-10 19:21
ym23(金币+2):欢迎常来交流 2010-09-07 22:24:28

（1）这种方法是采用 crystal builder 方法。必须保证 spgroup不等于0。也就是说必须自己设定值，abinit默认为0。我看你的input里面没有输入

（2）这种方法的缺点是：对于掺杂（特别是无序），这种输入方式无法建模。只能用unit cell 或者primitive cell (对于个别有序情况) 全部原子输入方式

[ Last edited by wenjlu on 2010-4-8 at 22:12 ]

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5楼2010-04-08 22:10:53

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